Název:
Redox signaling to chromatin
Autoři:
Plšková, Zuzana Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok:
2023
Jazyk:
eng
Abstrakt: [eng][cze] Chromatin is a highly dynamic structure, which is constantly subjected to regulation in response to environmental conditions. This response is mediated by chromatin modifiers, such as histone acetyltransferases, which deposit histone post-translational modifications, resulting in changes in gene expression. One of such modifiers in plants is GENERAL CONTROL NON-REPRESSIBLE 5 (GCN5). Despite its importance in plant growth and development, it remains poorly understood how GCN5 is regulated. Emergine evidence points towards redox regulation of chromatin remodeling that can be executed via redox modifications of chromatin modifiers. To investigate possible redox regulation of GCN5, we used redox insensitive lines, carrying GCN5 with mutated cysteine to serine. Even though gcn5 mutants displayed enhanced susceptibility to paraquat-induced oxidative stress, the mutated lines phenocopied the wild type. We further probed the interactome of GCN5 to identify putative functional partners, whose association with GCN5 could be altered under oxidative stress conditions, or affected by its redox status. Mutating of a single cysteine residue in GCN5 did not result in significant changes of its interactome, suggesting that additional single and higher order mutants need to be explored.Chromatin je velmi dynamická struktura, která podléhá neustálé regulaci v odpovědi na měnící se podmínky prostředí. Tato odpověď je zprostředkovaná enzymy modifikujícími chromatin, jako jsou histonové acetyltransferázy, které přenáší histonové posttranslační modifikace, což vede ke změnám genové exprese. Jedním z těchto enzymů v rostlinách je GENERAL CONTROL NON-REPRESSIBLE 5 (GCN5). Navzdory jeho důležitosti pro růst a vývoji rostlin stále není dostatečně popsáno, jak probíhá jeho regulace. Nové důkazy poukazují na možnou regulaci remodelace chromatinu prostřednictvím redoxně regulovaných enzymů modifikujících chromatin. Abychom prozkoumali možnou redoxní regulaci GCN5, použili jsme redoxně necitlivé linie nesoucí GCN5 s cysteinem zaměněným za serin. Přestože mutantní rostliny gcn5 vykazovaly zvýšenou náchylnost k oxidativnímu stresu vyvolanou paraquatem, linie s mutovaným GCN5 měly fenotyp podobný kontrolním rostlinám. Dále jsme sledovali interaktom GCN5, abychom identifikovali domnělé funkční interaktory, jejichž vazba na GCN5 by mohla být ovlivněna oxidativním stresem či jeho redoxním stavem. Mutace jediného cysteinu ve struktuře GCN5 nevedla k významným změnám jeho interaktoru, což naznačuje, že je třeba prozkoumat vícenásobné mutanty či mutace jiných cysteinů.
Klíčová slova:
chromatin; histone acetyl transferase; histonová acetyltransferáza; oxidative stress; oxidativní stres; reactive oxygen species; reaktivní druhy kyslíku; redox regulation; redoxní regulace
Instituce: Mendelova univerzita v Brně
(web)
Informace o dostupnosti dokumentu:
Text práce je neveřejný, pro více informací kontaktujte osobu uvedenou v repozitáři Mendelovy univerzity. Původní záznam: https://is.mendelu.cz/zp/index.pl?podrobnosti=120978