Název:
Hodnocení fenotypového projevu amplifikací proximální oblasti dlouhých ramen chromozomu 15
Překlad názvu:
Evaluation of phenotypic expression of proximal 15q chromosomal region amplifications
Autoři:
Duračková, Jana ; Slámová, Zuzana (vedoucí práce) ; Trková, Marie (oponent) Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok:
2023
Jazyk:
slo
Abstrakt: [eng][cze] Proximal region of the long arm of chromosome 15 (region 15q11-q13) is susceptible to occurence of deletions, duplications and inversions in the process of non-allelic homologous recombination due to the presence of five breaking points. Manifestation of these aberrations can differ depending on the parental origin of the derivative chromosome due to the presence of imprinted genes. Deletions of this region cause well-known disorders - Prader-Willi and Angelman syndromes. Phenotypic features linked to amplifications of this region (autism, developmental delay, speech delay, epilepsy, hypotonia) are variable and these amplifications are often inherited from a healthy parent. This thesis concerns itself with evaluation of phenotypic expression of amplifications of chromosomal region 15q11.2q13.3 in terms of genotype-phenotype correlation with the aim to contribute to explanation of these recurrent findings. A cohort of 36 patients with a detected amplification of this region was divided into multiple groups according to various criteria - size and gene content of the amplification, parental origin of the amplification and the presence of a second detected variant. Within these groups, we also took the number of copies and the location of the amplified region (interstitial amplification/marker...Proximálna oblasť dlhého ramena chromozómu 15 (oblasť 15q11-q13) je vzhľadom k prítomnosti piatich zlomových bodov náchylná na vznik delécií, duplikácií či inverzií v procese nealelickej homologickej rekombinácie. Prejavy týchto aberácií sa môžu líšiť v závislosti na parentálnom pôvode derivovaného chromozómu, vzhľadom k prítomnosti tzv. imprintovaných génov. Delécie tejto oblasti spôsobujú známe syndrómy - Prader- Williho a Angelmanov syndróm. Fenotypové znaky spájané s amplifikáciami tejto oblasti (autizmus, oneskorený vývin, oneskorený vývin reči, epilepsia, hypotónia) sú však variabilné a amplifikácie sú často zdedené od zdravého rodiča. Táto práca sa zaoberá hodnotením fenotypových prejavov amplifikácií chromozomálnej oblasti 15q11.2q13.3 z hľadiska genotypovo-fenotypovej korelácie, s cieľom prispieť k objasneniu týchto rekurentných nálezov. Súbor 36 pacientov s detegovanou amplifikáciou danej oblasti bol pre tento účel rozdelený podľa rôznych kritérií - rozsah a génový obsah amplifikácie, parentálny pôvod amplifikácie a prítomnosť druhého detegovaného variantu. V rámci jednotlivých skupín bol taktiež kladený dôraz na počet kópií amplifikovanej oblasti a jej lokalizáciu (intersticiálna amplifikácia/marker chromozóm). Okrem toho sme pre túto diplomovú prácu vytvorili druhý súbor, ktorý...
Klíčová slova:
Amplifikácie oblasti 15q11.2q13.3; Autizmus; Neúplná penetrancia; Oneskorený vývin; Variabilná expresivita; Amplifications of the 15q11.2q13.3 region; Autism; Developmental delay; Incomplete penetrance; Variable expressivity