Original title: Studium evoluce chromozómových přestaveb pipovitých žab pomocí fluorescenční in situ hybridizace
Translated title: Studying the evolution of chromosome rearrangements in pipid frogs using in situ hybridization
Authors: Bergelová, Barbora ; Knytl, Martin (advisor) ; Johnson Pokorná, Martina (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2023
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
U afrických pipovitých žab došlo k nejméně osmi nezávislým polyploidizačním událostem v rámci, kterých vzniklo velké množství ploidních úrovní. Můžeme zde nalézt jak diploidní druhy, tak druhy tetraploidní, oktoploidní či dodekaploidní. Díky tomu jsou zástupci rodu Xenopus skvělým modelovým organismem pro studium evoluce celogenomových duplikací a chromozomových přestaveb. V současné době je známo pouze málo informací o chromozomálních přestavbách v rámci druhu Xenopus, přesněji pouze o dvou přestavbách velkého rozsahu. Jedná se o fúzi chromozomu 9 a 10 u podrodiny Xenopus a nereciprokou translokaci v rámci chromozomů 2 a 9 u podrodiny Silurana. V rámci této diplomové práce jsme se pomocí metody fluorescenční in situ hybridizace pokusili o rozšíření znalostí o chromozomálních přestavbách, díky čemuž jsme potvrdili fúzi chromozomů 9 a 10 i v rámci dalších druhů rodu Xenopus, jako je X. pygmaeus, a předkládáme hypotézu o možnosti vzniku fúze u původních diploidních předků této podrodiny. Také se nám podařilo blíže upřesnit vznik nereciproké translokace v rámci podrodiny Silurana. Tuto translokaci jsme neprokázali u druhu X. calcaratus a můžeme tedy určit, že k translokaci nejspíše došlo u společného předka X. epitropicalis a X. mellotropicalis, či u samotného X. mellotropicalis. V rámci podrodiny... In African pipid frogs we can find at least eight polyploidization events in which a lot of levels of ploidy arose. This group includes diploid, tetraploid, octoploid, and/or dodecaploid species. Due to this great variability in ploidy levels, representatives of the genus Xenopus are excellent model organisms for studying the evolution of whole-genome duplications and chromosomal rearrangements. Currently, little information is known about chromosomal rearrangements within the Xenopus species, specifically, there are only two known cases of large-scale rearrangements. The first is a fusion of chromosomes 9 and 10 in the subgenus Xenopus and the other rearrangement is a non-reciprocal translocation occurring between chromosomes 2 and 9 in the subgenus Silurana. In this diploma thesis, we attempted to expand the knowledge about chromosomal rearrangements using the fluorescence in situ hybridization method. We confirmed the fusion of chromosomes 9 and 10 in other species of the Xenopus genus, such as X. pygmaeus, and proposed a hypothesis about the possibility that this fusion occurred in the common diploid ancestors of this subgenus. We also gained further insights into the origin of non-reciprocal translocation within the Silurana subgenus. This translocation was not detected in the species X....
Keywords: chromosomal rearrangements; FISH-TSA; fusion; inversion; translocation; Xenopus; chromozomální přestavby; FISH-TSA; fúze; inverze; translokace; Xenopus

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/185242

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-534984


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses