Original title: Virové proteiny v replikaci RNA
Translated title: Viral proteins that facilitate RNA replication
Authors: Černý, Prokop ; Bouřa, Evžen (advisor) ; Faltová, Lenka (referee)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2023
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Patogenní lidský koronavirus SARS-CoV-2 (z angl. Severe Accute Respiratory Syndrome Coronavirus 2) způsobil v posledních letech celosvětovou pandemii vysoce infekčního onemocnění COVID-19 (z angl. coronavirus disease 2019). Podle Světové zdravotnické organizace bylo k 20. srpnu 2023 zaznamenáno téměř 770 milionů potvrzených případů a takřka 7 milionů úmrtí spojených s tímto onemocněním. V současné době je však známo pouze malé množství účinných antivirotik, která pomáhají léčit toto onemocnění v již infikovaných pacientech. V této práci proto byla studována interakce hostitelských proteinů 14-3-3 s nukleokapsidovým proteinem viru SARS-CoV-2, jakožto potenciální biologický cíl pro racionální návrh nových antivirotik. Význam této interakce v životním cyklu viru nebyl doposud zcela objasněn, pravděpodobně však má důležitou regulační funkci ovlivňující vícero procesů v napadené buňce. Nukleokapsidový (N) protein SARS-CoV-2 ve své sekvenci obsahuje několik vazebných motivů pro 14-3-3 proteiny, z nichž dva (na pozicích S197 a T205), nejpravděpodobněji zodpovědné za interakci mezi těmito proteiny, byly studovány v této práci. Pro určení afinity jednotlivých fosforylačních míst na N proteinu k proteinu 14-3-3ζ byla provedena termoforéza v mikroměřítku. Jako klíčový fosforylovaný zbytek zodpovědný za vazbu... In recent years, the pathogenic human coronavirus SARS-CoV-2 (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2) has caused a global pandemic of highly infectious disease COVID--19 (coronavirus disease 2019). According to the World Health Organization, as of August 20, 2023, there have been nearly 770 million confirmed cases and nearly 7 million deaths associated with the disease. However, only a small number of effective antiviral drugs are currently known to help treat the disease in already infected patients. Therefore, in this work, the interaction of host 14-3-3 proteins with the nucleocapsid protein of SARS-CoV-2 was studied as a potential biological target for the rational design of new antiviral drugs. The importance of this interaction in the virus life cycle has not been fully elucidated, but it probably has an important regulatory function affecting multiple processes in the infected cell. The SARS-CoV-2 N protein contains several binding motifs for 14-3-3 proteins in its sequence, two of which (at positions S197 and T205), most likely responsible for the protein- protein interaction, were studied in this work. Microscale thermophoresis was performed to determine the affinity of each of these phosphorylation sites on the nucleoprotein for the 14-3-3ζ protein. The key phosphorylated residue...
Keywords: 14-3-3 protein; coronavirus; N protein; SARS-CoV-2; 14-3-3 protein; koronavirus; N protein; SARS-CoV-2

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/185498

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-534964


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses