Original title: Webový plugin pro vizualizaci sady sekundárních struktur RNA
Translated title: Web plugin for multiple RNA secondary structure visualization
Authors: Hercík, Michal ; Hoksza, David (advisor) ; Lokoč, Jakub (referee)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2023
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Zkoumání RNA je důležité pro lepší pochopení evoluce nebo některých onemocnění. V této práci představujeme knihovnu napsanou v jazyce Typescript, která nabízí metody pro vizuální analýzu více sekundárních struktur RNA, nejlépe ale metody fungují pří práci s dvěmi nebo třemi strukturami. Pro reprezentaci používáme radial diagram, který je vygenerovaný na základě vzorové struktury. Metody použité v knihovně pro analýzu využívají způsobu generování radial diagramu a to tak, že diagramy vygenerované ze stejné vzorové struktury na sebe mapuje právě pomocí vzorové struktury, díky tomu lze sledovat rozdíly a podobnosti struktur. 1 The study of RNA is important to better understand evolution or some diseases. In this thesis, we present a library written in Typescript that offers methods for visual analysis of multiple RNA secondary structures, but preferably work best with two or three structures. For the representation we use radial diagram, which is generated by template-based method. Methods used in the library for analysis use the template-based generation of the radial diagram by mapping diagrams generated from the same template to each other via the template, so that differences and similarities of structures can be observed. 1
Keywords: bioinformatics|RNA|secondary structure|web|plugin; bioinformatika|RNA|sekundární struktura|web|plugin

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/183060

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-532538


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses