Original title: Analýza low-copy sekvencí a její využití pro hodnocení polymorfismu kmenů/izolátů \kur{Beauveria bassiana}
Translated title: Analysis of low-copy sequences and its utilization for evaluation of genetic polymorphism in selected \kur{Beauveria bassiana} strains/isolates
Authors: JOZOVÁ, Eva
Document type: Master’s theses
Year: 2010
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Beauveria bassiana je využívaná v biologické kontrole proti hospodářsky významným škůdcům. Detekce morfologického i genetického polymorfismu mezi jednotlivými izolovanými druhy a kmeny v přirozeném prostředí je důležitá ke studiu jejich šíření a působení v ekosystému. Cílem této studie bylo zjistit, v jakém propojení jsou {\clqq}lokální kmeny`` s ekologickými aspekty biologické kontroly v chráněné zóně a zhodnotit polymorfismus jednotlivých úseků pomocí metod molekulárních markerů. Bylo analyzováno 36 kmenů odebraných v Národním parku Šumava v České republice. Polymorfismus těchto kmenů byl zjišťován podle sekvencí LSU (28S velká podjednotka ribosomální DNA). Vypozorovali jsme, že populace pocházející z Národního parku Šumava je velmi uzavřená. {\clqq}Lokální kmeny`` lze díky těmto metodám velmi dobře charakterizovat i ve srovnání s jinými kmeny z odlišných částí České republiky i z jiných zemí. Populace z Národního parku Šumava nevykazuje žádné rozdíly v polymorfismu. Díky této analýze byl ujednocen vzorek Bba I101. Tento preparát je opětovně používán na lýkožrouta smrkového, vyskytujícího se v Národním parku Šumava v České republice. Tato studie byla podporována granty GAČR 521/08/H042, MSM 60076658-06, MZP SP/2d1/41/08. Beauveria bassiana is used in biological control against the economically significant pests. Detection of morphological and genetic polymorphism between different species and strains isolated in the natural environment is important to study the distribution and effects in the ecosystem. The aim of this study was to determine in which links are "local tribes" with ecological aspects of biological control in protected zone and assess the polymorphism of the sections by using molecular markers. Were analyzed 36 strains collected in the National Park Šumava in the Czech Republic. Polymorphism of these strains was determined according to a sequence of LSU (28S Large Subunit Ribosomal DNA). It is observed that the populations from National Park is closed, "the local tribes" because these methods can be very well characterized and compared with other strains from different parts of the Czech Republic and other countries. Populations from National Park showed no differences in polymorphism. Through this analysis, the sample Bba I101 was aligned. This preparation is re-used for bark beetle occurring in the National Park Šumava in the Czech Republic. This study was supported by grants GACR 521/08/H042, MSM 60076658-06, MGA SP/2d1/41/08.
Keywords: \kur{Beauveria bassiana}; entomopathogenic fungi; LSU; molecular markers; rRNA; suquencing analysis; \kur{Beauveria bassiana}; entomopatogenní houby; LSU; molekulární markery; rRNA; sekvenační analýza
Citation: JOZOVÁ, Eva. Analýza low-copy sekvencí a její využití pro hodnocení polymorfismu kmenů/izolátů \kur{Beauveria bassiana}. České Budějovice, 2010. diplomová práce (Ing.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Fakulta zemědělská a technologická

Institution: University of South Bohemia in České Budějovice (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Original record: http://www.jcu.cz/vskp/15221

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-53173


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > University of South Bohemia in České Budějovice
Academic theses (ETDs) > Master’s theses