Original title:
Analýza trombu ve vícefázických CT datech u ischemické mozkové příhody
Translated title:
Ischemic thrombus analysis in multiphasic brain stroke CT data
Authors:
Mikešová, Tereza ; Holeček, Tomáš (referee) ; Jakubíček, Roman (advisor) Document type: Master’s theses
Year:
2023
Language:
cze Publisher:
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií Abstract:
[cze][eng]
Diplomová práce se zabývá analýzou trombů v mozkových vícefázických CT datech. V teoretické části práce je vypracována rešerše metod zejména segmentace trombů. Dále je v této části shrnutá anatomie mozkových tepen a přiblížena cévní mozková příhoda. Stručně jsou popsány vybrané metody z oblasti zpracování obrazu. Výsledkem praktické části je porovnání metod segmentace trombů. Samotné segmentaci předcházelo předzpracování dat, které je v práci popsáno, a vytvoření manuální anotační databáze. Nejlepší implementovanou metodou se ukázala metoda adaptivního prahování, která dosáhla Dice skóre 0,4555. Vhodným zkombinováním všech metod bylo dosaženo finálního Dice skóre 0,5145. Ze segmentovaných objemů byly následně vypočítány parametry trombů. Mediánová hodnota průměrné intenzity dosáhla na 51,55 HU, medián délky byl 15,16 mm a mediánový objem byl stanoven na 65,34 mm3. Následná korelační analýza neukázala žádný významný vztah mezi odvozenými parametry.
This master thesis deals with analysis of ischemic thrombus in brain CT scans. In theoretical part, a review of methods, especially thrombus segmentation, is developed. Furthermore, the anatomy of cerebral arteries and acute ischemic stroke is summarized. Selected methods from the field of image processing are briefly described. The practical part results in a comparison of thrombus segmentation methods. The segmentation itself was preceded by data preprocessing, which is described in the theses, and the creation of a manual annotation database. The best implemented method was found to be the adaptive thresholding method, which achieved a Dice score of 0,4555. By combining the methods appropriately, a final Dice score of 0,5145 was achieved. Thrombus parameters were then calculated from the segmented volumes. The median intensity value was 51,55~HU, the median length was 15,16 mm, and the median volume was determined to be 65,34 mm3. Subsequent correlation analysis showed no significant relationship between the derived parameters.
Keywords:
CT angiography; k-means; region growing.; registration; segmentation; Stroke; thresholding; thrombus; CT angiografie; Cévní mozková příhoda; metoda k-průměrů; narůstání oblastí.; prahování; registrace; segmentace; trombus
Institution: Brno University of Technology
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library. Original record: http://hdl.handle.net/11012/210048