Original title: Imaging of fluorescence emission signals from healthy and infected leaf tissues
Translated title: Imaging of fluorescence emission signals from healthy and infected leaf tissues
Authors: BENEDIKTYOVÁ, Zuzana
Document type: Doctoral theses
Year: 2009
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Auto-fluorescence rostlinných pletiv může sloužit jako zdroj významných informací o biochemických a fyziologických procesech probíhající v rostlinném organismu. Je totiž vyzařována látkami vlastními rostlině, které jsou obvykle spjaty s primárním nebo sekundárním metabolismem. Rostlinná těla jsou plná fluorescenčních sloučenin, které vyzařují téměř v celém spektru viditelného a částečně i infračerveného záření. Navíc byla tato bohatá škála fluorescenčních reporterů nedávno rozšířena o paletu uměle vnesených fluorescenčních proteinů. Fluorescenční proteiny jsou novodobým nástrojem, který umožňil geneticky značit celé buňky nebo jimi obsahované struktury, studovat lokalizaci proteinů a monitorovat expresi genů nebo molekulární interakce. Zavedení zobrazovacích technik k monitorování fluorescenčních signálů otevřelo možnost získat informaci z milionů bodů současně. Neocenitelnou výhodou těchto v technik je jejich neinvazivní charakter, zachovávají integritu buněk i celého organismu. Zobrazování je vhodné zejména k studiu prostorové heterogenity, například lokalizovanou imunitní odpověď rostliny na pronikající patogen. Zobrazovací metody můžou být použity na úrovni makroskopické nebo mikroskopické, ve dvou nebo třech prostorových dimenzích. Současný pokrok v mikroskopii a zvláště multifotonová mikroskopie otevřela možnost monitorovat fluorescenční signály, které nejsou přístupné pro jednofotonové techniky. Jedným z nich je NAD(P)H fluorescence z nitra intaktního listu. Auto-fluorescence emission of plant tissues can be a powerful reporter on plant biochemistry and physiology since it originates in substances inherent to primary or secondary metabolism. Plant bodies contain a plethora of intrinsic fluorescent compounds emitting practically all wavelengths of visible light. Moreover, the spectrum of fluorescent reporter signals was recently extended by a variety of fluorescent proteins that provide a new tool to mark whole cells or sub-cellular structures, study protein localization and monitor gene expression and molecule interactions. The imaging of such fluorescence signals reveals a possibility to acquire the information from as many as millions of points simultaneously, in vivo and in a non-invasive way thereby preserving integrity of cells and whole organisms. Imaging is particularly suited to visualize heterogeneity such as a localized immune response to invading pathogens. It can be applied both at macro- as well as micro-scales in two and three dimensions. The recent advancement in microscopy, the multi-photon microscopy, has made possible to monitor fluorescence signals, such as NAD(P)H fluorescence from intact leaf interior, that have been hidden to single-photon techniques.
Keywords: biotic stress; blue-green fluorescence; chlorophyll fluorescence; chloroplast; classification; combinatiorial fluorescence imaging; forced oscillations; GFP; image processing; image segmentation; jasmonic acid; OPDA; photosynthesis; piridine nucleotide; plant phenolics; salicilic acid; ttwo-photon microscopy; biotický stres; chlorofylová fluorescence; chloroplast; dvou-fotonová mikroskopie; fotosynteza; klasifikace; kombinatoriální fluorescenční zobrazování; kyselina jasmónová; kyselina salicilová; modrá a zelená fluorescence; nucené oscilace; OPDA; piridín-nukleotid; rostlinné fenolické látky; segmentace obrazu; zelený fluorescenční protein; zpracování dat
Citation: BENEDIKTYOVÁ, Zuzana. Imaging of fluorescence emission signals from healthy and infected leaf tissues. N. Hrady, 2009. disertační práce (Ph.D.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. ***Ústav fyzikální biologie

Institution: University of South Bohemia in České Budějovice (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Original record: http://www.jcu.cz/vskp/12644

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-52374


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > University of South Bohemia in České Budějovice
Academic theses (ETDs) > Doctoral theses