Original title: Fylogeografie a genetická variabilita \kur{Diuraphis noxia} (\kur{Aphididae})
Translated title: Fylogeography and genetics variability of \kur{Diuraphis noxia} (\kur{Aphididae})
Authors: PAŠÍKOVSKÝ, Jiří
Document type: Master’s theses
Year: 2011
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Podstatou práce byl výzkum genetické variability přírodních populací Diuraphis noxia (Aphididae) pomocí mikrosatelitních markerů a markerů pro EPIC-PCR. Prvním cílem bylo zavedení metody pro mikrosatelitní lokusy a její optimalizace Diuraphis noxia. Poté následovalo zavedení metody EPIC-PCR a její optimalizace pro Diuraphis noxia. Poté následovala samotná pilotní studie, ve které byli analyzováni jedinci ze 47 lokalit z celého světa. Pomocí mikrosatelitních markerů byla potvrzena očekávaná variabilita mezi jednotlivými populacemi i uvnitř populací. Metodou EPIC-PCR byla zjištěna největší genetická variabilita mezi Chile a Alžírskem za použití markeru pro cytochrom C. Tyto poznatky lze dále využit ke komplexní studii Diuraphis noxia. The aim of this work was a research of the genetic variability of natural populations of Russian wheat aphid Diuraphis noxia (Aphididae) by means of microsatellite markers and markers for EPIC-PCR. First goal was to introduce the methods and optimise them for Diuraphis noxia. In the follow-up pilot study, specimens from 47 lines representing 12 populations from all over the world were analysed. Having used microsatellite markers, I proved expected variability among individual populations and within them. The highest genetic variability was detected between Chile and Algeria using markers for cytochrome C in EPIC-PCR. These findings can be used for further studies of the genetic variability of the aphid Diuraphis noxia.
Keywords: agarose gel; aphid; Diuraphis noxia; electrophoresis; EPIC-PCR; genetic diversity; locus; marker; microsatellite; polyacrylamide gel; sequencing; variability; agarózový gel; Diuraphis noxia; elektroforéza; EPIC-PCR; genetická diverzita; lokus; marker; mikrosatelit; mšice; polyakrylamidový gel; sekvenování; variabilita
Citation: PAŠÍKOVSKÝ, Jiří. Fylogeografie a genetická variabilita \kur{Diuraphis noxia} (\kur{Aphididae}). České Budějovice, 2011. diplomová práce (Mgr.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Institution: University of South Bohemia in České Budějovice (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Original record: http://www.jcu.cz/vskp/14356

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-51983


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > University of South Bohemia in České Budějovice
Academic theses (ETDs) > Master’s theses