Original title: Detekce patogenů zemědělských plodin pomocí metagenomické analýzy
Translated title: Detection of crop pathogens by metagenomic analysis
Authors: KOLÁŘOVÁ, Johana
Document type: Master’s theses
Year: 2020
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
V rámci této práce byly pomocí sekvenační analýzy genů pro rRNA identifikovány mikroorganismy osidlující osivo pšenice seté (Triticum aestivum L.) a řepky olejné (Brassica napus L.). Bakterie byly identifikovány dle sekvence části genu pro 16S rRNA a houby dle sekvence části genu pro 28S rRNA. Následně byl posuzován vliv ošetření osiva nízkoteplotním plazmatem na životaschopnost detekovaných mikroorganismů. Microorganisms colonizing seed of wheat (Triticum aestivum L.) and oilseed rape (Brassica napus L.) were identified by sequencing analysis of genes encoding rRNA in this thesis. Bacteria were identified according to the sequence of part of gene for 16S rRNA and fungi were identified according to the sequence of part of gene for 28S rRNA. Subsequently, the effect of low-temperature plasma seed treatment on the viability of the detected microorganisms was assessed.
Keywords: elimination of microorganisms; gene encoding 16S rRNA; gene encoding 28S rRNA; low-temperature plasma; metagenomic analysis; phytopathogens; eliminace mikroorganismů; fytopatogeny; gen kódující 16S rRNA; gen kódující 28S rRNA; metagenomická analýza; nízkoteplotní plazma
Citation: KOLÁŘOVÁ, Johana. Detekce patogenů zemědělských plodin pomocí metagenomické analýzy. České Budějovice, 2020. diplomová práce (Ing.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Fakulta zemědělská a technologická

Institution: University of South Bohemia in České Budějovice (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Original record: http://www.jcu.cz/vskp/57595

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-514776


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > University of South Bohemia in České Budějovice
Academic theses (ETDs) > Master’s theses