Original title: Analýza vybraných W obohacených repetic u předivky brslenové \kur{Yponomeuta cagnagella} (Lepidoptera)
Authors: PILÍKOVÁ, Aneta
Document type: Bachelor's theses
Year: 2019
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Tato práce se zabývá studiem vybraných repetitivních DNA sekvencí na pohlavním chromosomu W u herbivorního škůdce předivky brslenové (Yponomeuta cagnagella) (Lepidoptera). Metodami fluorescenční in situ hybridizace (FISH) a kvantitativní PCR (qPCR) byla zjišťována distribuce vybraných repetic v genomu předivky a porovnáváno množství jejich kopií mezi jedinci různého pohlaví ze dvou geografických populací. Zatímco u satelitní DNA a transposonu byla přítomnost na chromosomu W potvrzena, klastr rDNA genů se u předivky brslenové pravděpodobně nachází na autosomu u obou testovaných populací, navzdory předchozím bioinformatickým analýzám. Studium distribuce repetic přímo na chromosomech ukázalo na akumulaci transposonu Maverick v rozsáhlých oblastech na obou koncích chromosomu W. This thesis focuses on the repetitive sequences located in the W chromosome of the spindle ermine moth (Yponomeuta cagnagella) (Lepidoptera). The copy number of the selected repeats was established in male and female genomes from two geographic populations using real-time PCR (qPCR). Fluorescence in situ hybridization (FISH) was used to localize these sequences in female pachytene nuclei. The satellite tandem repeat and the transposon Maverick are present in the W chromosome in high copy numbers. In contrast to previously conducted bioinformatical analyses, the rDNA cluster is probably localized in an autosome in Y. cagnagella. The Maverick transposon was detected in both extensive terminal regions of the W chromosome.
Keywords: chromosom W; FISH; qPCR; repetitive DNA; satellite; small ermine moth; transposon; Yponomeuta cagnagella; chromosom W; FISH; populace; předivka brslenová; qPCR; repetitivní DNA; satelit; transpozon; Yponomeuta cagnagella
Citation: PILÍKOVÁ, Aneta. Analýza vybraných W obohacených repetic u předivky brslenové \kur{Yponomeuta cagnagella} (Lepidoptera). České Budějovice, 2019. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Institution: University of South Bohemia in České Budějovice (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Original record: http://www.jcu.cz/vskp/55618

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-514074


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > University of South Bohemia in České Budějovice
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses