Název: Evoluce symbiotických bakterií dvoukřídlého krevsajícího hmyzu
Autoři: JUHAŇÁKOVÁ, Eliška
Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok: 2020
Jazyk: cze
Abstrakt: [cze] [eng]
Tato práce se zaměřuje na bakteriální symbionty krevsajícího hmyzu z čeledi Hippoboscidae (Diptera), jmenovitě Ornithomya biloba a Crataerina pallida. Bakteriální symbionti poskytují krevsajícímu hmyzu živiny chybějící v krvi, zejména B vitamíny a kofaktory. V této práci byla metagenomická data z klošů Ornithomya biloba a Crataerina pallida zpracována bioinformatickými nástroji do podoby dvou genomů. Genomy dvou bakteriálních symbiontů rodu Arsenophonus byly porovnány s jejich příbuznými na úrovni genomové modifikace. Kromě toho byla v obou genomech bakterií rodu Arsenophonus fylogeneticky prověřena přítomnost horizontálně přenesených genů. Nakonec byly rekonstruovány metabolické dráhy esenciálních B vitamínů a kofaktorů a porovnány s dalšími bakteriemi rodu Arsenophonus. This study is focused on bacterial symbionts of blood-sucking insects from the family Hippoboscidae (Diptera), namely Ornithomya biloba and Crataerina pallida. Bacterial symbionts are essential for blood-sucking insects because they provide nutrients absent in blood, particularly vitamin B and cofactors. In this study metagenomic data from Ornithomya biloba and Crataerina pallida were processed by bioinformatic tools and genome drafts were assembled. Genomes of two bacterial symbionts of the genus Arsenophonus were compared with their relatives and levels of genomic modification of these genomes were evaluated. Moreover, the presence of horizontally transferred genes in both Arsenophonus genomes was phylogenetically determined. Finally, metabolic pathways for essential B vitamins and cofactors were reconstructed and compared with other species of the genus Arsenophonus.
Klíčová slova: Arsenophonus; B vitamíny; bakterie; horizontální přenos Hippoboscidae; kloši; symbiont; Arsenophonus; B vitamins; bacteria; Hippoboscidae; horizontal transfer; louse flies; symbiont
Citace: JUHAŇÁKOVÁ, Eliška. Evoluce symbiotických bakterií dvoukřídlého krevsajícího hmyzu. České Budějovice, 2020. diplomová práce (Mgr.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Instituce: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v digitálním repozitáři JČU.
Původní záznam: http://www.jcu.cz/vskp/53470

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-513848


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Vysokoškolské kvalifikační práce > Diplomové práce