Original title: Studium historického rozšíření linií pstruha obecného v ČR a na Slovensku pomocí vybraných znaků mitochondriální DNA
Translated title: Study of historical expansion of brown trout lineages in the Czech republic and in Slovakia republic with using mtDNA markers.
Authors: JAŠKOVÁ, Iva
Document type: Master’s theses
Year: 2009
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Pstruh obecný (Salmo trutta) je ekologicky, ekonomicky a esteticky významný druh ryby, jehož nedostatečná ochrana v Evropě vyžaduje další pozornost a péči. Stále pokračující eroze genetických zdrojů populací pstruha obecného vlivem antropogenních činností žádá změny současných trendů. Studovali jsme genetickou diverzitu populací pstruha na území České republiky a Slovenska s využití genetických markerů. Na úsecích mitochondriální DNA (gen pro ND-5/6) a jaderné DNA (gen pro LDH1) namnožených pomocí PCR byly hledány rozdíly s využitím RFLP. V testovaných populacích bylo nalezeno celkem sedm haplotypů, čtyři z nich byly zastoupeny téměř ve všech populacích. {\clqq}Dunajské haplotypy`` byly striktně omezeny na povodí Dunaje a Visly, {\clqq}atlantické haplotypy`` dominovaly ve všech povodích, největší zdroj variací (72 %) byl uvnitř populací. Na úseku LDHC1٭ byly nalezeny dvě alely {--} původní ٭100 a ٭90 (při vysoké frekvenci výskytu). Tyto genomové změny jsou přičítány antropogenním vlivům. The brown trout (Salmo trutta) is an ecologically, economically, aesthetically fish species whose poor conservation status in the European countries calls for further attention and action. The continuing erosion of the genetic resources of brown trout populations by human activities calls for strategies to reverse the current trend. We studied a genetic diversity of population of brown trout in the territory of Czech R. and in Slovakia using genetic markers. In the fragments of mitochondrial DNA (gen for ND-5/6) and nuclear DNA (gen for LDH1) amplified through PCR the differences were searched with the use of RFLP. In tested populations seven haplotypes were founded, four haplotypes were represented in almost of all populations. The ``Danubian haplotypes{\crqq} were strictly confined to the Danubian and Vistula drainages, the ``Atlantic haplotypes{\crqq} dominated in all populations, most of the total molecular variance (72 %) was attributed to differences within populations. Two alleles at LDHC1٭ - the ancestral ٭100 and ٭90 (at a high frequency) were revealed. This genotypic replacement is considered to be due to anthropogenic activities.
Keywords: LDH1; ND5/6; PCR-RFLP; Salmo trutta; LDH1; ND5/6; PCR-RFLP; Salmo trutta
Citation: JAŠKOVÁ, Iva. Studium historického rozšíření linií pstruha obecného v ČR a na Slovensku pomocí vybraných znaků mitochondriální DNA. České Budějovice, 2009. diplomová práce (Ing.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Fakulta zemědělská a technologická

Institution: University of South Bohemia in České Budějovice (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Original record: http://www.jcu.cz/vskp/7703

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-51256


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > University of South Bohemia in České Budějovice
Academic theses (ETDs) > Master’s theses