Original title: Úloha mikroRNA v regulaci vývoje oocytů a embryí savců
Translated title: The role of microRNAs in regulation of mammalian oocyte and embryo development
Authors: Marcollová, Kateřina ; Procházka, Radek (advisor) ; Svoboda, Petr (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2022
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
Cumulus-oocyte complex (COCs) is crucial for mammalian reproduction. Cumulus cells not only nurture the oocyte; they also represent important communicational nodes for mediating information towards and from the oocyte. The non-coding miRNAs can modulate posttranscriptional events they might serve as a useful biomarker for evaluating cell conditions. Based on the COCs staining with vital Lissamine Green B stain we divided cumulus cells into high- and low-quality ones. Furthermore, we implemented division based on the maturation stage, the GV and MII. Sequencing data analysis showed that DE miRNAs from qualitatively different stages donot significantly vary. Nonetheless, significantly DE miRNAs were detected between two developmentally different stages. We identified e.g. ssc-miR-183, ssc-miR-182, and ssc-miR-21-5p to be highly downregulated when comparing GV to MII stage. Among the highly expressed miRNAs from all samples were members of let-7 family (let-7c, let-7a, let- 7f-5p), ssc-miR-16, ssc-miR-21-5p, and ssc-miR-125a. Targeted genes by the DE miRNAs were involved in ErbB, TGF-β, MAPK, FoxO, gap junction and cGMP signalling pathways. We conclude that single miRNAs in cumulus cells probably cannot be used as a reliable oocyte quality marker. On the other hand,changes in the miRNA expression in... Komplex kumulárních buněk a oocytu je nezbytný pro savčí reprodukci. Kumulární buňky pouze nevyživují oocyt, ale take představují důležitý komunikační bod pro předávání informací k a od oocytu. Nekódující miRNAs jsou schopny regulavat posttranskripční události a díky tomu mohou posloužit jako vhodný biomarker pro hodnocení stavu buněk. Na základě barvení COCs pomocí vitalní barvičky Lissamine Green B jsme kumulární buňky rozdělelili na více a méně kvalitní skupinu. Navíc jsme začlenili rozdělení podle GV a MII vývojového stadia. Analýza sekvenačních dat neukázala signifikantní rozdíly v DE miRNA z kvalitativně rozdílných stádií. Nicméně, rozdíly v DE miRNA byly detekovány mezi dvěma vývojově rozdílnými stádii. Identifikovali jsme např. ssc-miR-183, ssc-miR-182, a ssc-miR-21-5p jako značně downregulované v porovnání GV a MII stadia. Členové let-7 rodiny (let-7c, let-7a, let- 7f-5p), ssc-miR-16, ssc-miR-21-5p a ssc-miR-125a patřily k nejvíce exprimovaným miRNA ve všech vzorcích. Geny, ke kterým se vztahovaly DE miRNA se týkaly především ErbB, TGF-β, MAPK, FoxO, gap junction a cGMP signálních drah. Usuzujeme, že jednotlivé miRNA v kumulárních buňkách pravděpodobně nemohou sloužit jako spolehlivý indikátor kvality oocytu. Na druhé straně, změny v expresi miRNA v kumulárních buňkách během zrání COCs by...
Keywords: cattle; development; embryo; miRNA; oocyte; pig; embryo,vývoj; miRNK; oocyt; prase; skot

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/176663

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-510346


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses