Original title: Úloha jaderně kódovaných podjednotek cytochrom c oxidázy v mitochondriálním metabolismu
Translated title: The role of nuclear-encoded subunits of cytochrome c oxidase in mitochondrial metabolism
Authors: Čunátová, Kristýna ; Pecina, Petr (advisor) ; Gahura, Ondřej (referee) ; Ugalde, Cristina (referee)
Document type: Doctoral theses
Year: 2022
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
Mitochondria, 'the powerhouses of the cell', house the integral metabolism pathway of oxidative phosphorylation to produce the majority of cellular energy. Mammalian cytochrome c oxidase, also called complex IV (cIV), is indispensable for the overall oxidative phosphorylation function as the terminal oxidase, and for its regulation to sustain energetic needs. Since cIV is a multimeric enzyme composed of subunits encoded by nuclear and mitochondrial genomes, its biogenesis is a complicated process, which needs to be coordinated to complete a fully functional complex. Further, the setup of individual nuclear-encoded subunits isoforms of cIV may fine-tune cIV function based on the tissue or the environment context. Despite the physiological and pathological relevance of cIV composition, biogenesis, and the secondary deficiencies triggered by cIV defects, nuclear-encoded subunits' function remains poorly understood. At first, mammalian COX4 subunit isoforms with tissue- and oxygen-dependent expression were studied in the HEK293 cellular model with an exclusive expression of COX4I1 or COX4I2 isoform. Remarkably, the COX4I2 isozyme showed lower affinity to oxygen, which may imply regulation of cIV activity under hypoxia, and is of physiological relevance for the oxygen-sensing mechanism. Further,... V mitochondriích, takzvaných 'buněčných elektrárnách', probíhá integrální metabolická dráha oxidační fosforylace, jež v buňkách zajišťuje produkci většiny energie. Savčí cytochrom c oxidáza, neboli cIV, je nezbytnou terminální oxidázou pro funkci systému oxidační fosforylace, ale také pro regulaci celého procesu k zajištění energie za daných podmínek. cIV je proteinový komplex sestavený z podjednotek kódovaných jaderným i mitochondriálním genomem, proto jeho biogeneze představuje komplikovaný proces vyžadující koordinaci mnoha dějů nezbytných k sestavení plně funkčního enzymu. Mimo to, sestavení cIV z jednotlivých isoforem jaderně- kódovaných podjednotek umožňuje funkční nastavení enzymu v závislosti na daných podmínkách. Navzdory dokladům o důležitosti správného sestavení cIV za fyziologických i patologických podmínek, úloha jaderně-kódovaných podjednotek není stále zcela objasněna. V této práci byly nejprve studovány isoformy podjednotky COX4, které vykazují expresi závislou na tkáni a koncentraci kyslíku. Pro tento účel byly využity HEK293 buněčné modely s výhradní expresí samotných isoforem COX4I1 nebo COX4I2. Zajímavým výsledkem bylo zjištění, že COX4I2 isozym vykazoval nižší afinitu ke kyslíku, což může hrát významnou roli v regulaci aktivity cIV za hypoxie a v mechanismu detekce koncentrace...
Keywords: assembly,supercomplexes; COX4; COX6B; cytochrome c oxidase; integrated stress response; interdependence; isoforms; oxidative phosphorylation; asemblace,superkomplexy; COX4; COX6B; cytochrom c oxidáza; integrovaná odpověď na stres; isoformy; oxidační fosforylace; vzájemná závislost

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/175570

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-509060


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Doctoral theses