Název:
Optimalizace postupu izolace fosforylovaných peptidů ze směsi metodou afinitní chromatografie na oxidech kovů pro analýzu hmotnostní spektrometrií
Překlad názvu:
Optimization of procedure for isolation of phosphorylated peptides from a peptide mixture by metal oxide affinity chromatography for mass spectrometry analysis
Autoři:
Popovská, Lenka ; Solich, Petr (vedoucí práce) ; Zemanová, Lucie (oponent) Typ dokumentu: Rigorózní práce
Rok:
2017
Jazyk:
cze
Abstrakt: [cze][eng] Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra analytické chemie Kandidát: Mgr. Lenka Popovská Školitel: Prof. RNDr. Petr Solich, CSc. Školitel specialista: Mgr. Barbora Šalovská, Ph.D. Název rigorózní práce: Optimalizace postupu izolace fosforylovaných peptidů ze směsi metodou afinitní chromatografie na oxidech kovů pro analýzu hmotnostní spektrometrií. Fosforylace proteinů je klíčovým regulačním mechanismem buněčné signalizace. Je součástí většiny buněčných dějů, jež se odehrávají za komplexní souhry proteinkináz a proteinfosfatáz, a mezi které řadíme především proliferaci, diferenciaci a apoptózu. Defektní či pozměněné signální dráhy mohou vést ke vzniku různých chorob, a proto je velmi důležité proteinovou fosforylaci podrobně studovat a snažit se jí co nejvíce porozumět. Technologický vývoj hmotnostní spektrometrie (MS) posledních let umožnil výrazné zvýšení počtu fosforylačních míst, které mohou být ve vzorku identifikovány. Zvyšující se skenovací rychlost společně s komerční dostupností MS s vysokým rozlišením zvýšily množství a kvalitu dat, které mohou být získány v relativně krátkém čase. Avšak ani špičkové přístroje by neumožnily komplexní identifikaci fosforylačních míst v enzymatických lyzátech (digestech) vzorků, pokud by samotné analýze nepředcházela některá z...Charles University Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Analytical Chemistry Candidate: Mgr. Lenka Popovská Supervisor: Prof. RNDr. Petr Solich, CSc. Consultant Supervisor: Mgr. Barbora Šalovská, Ph.D. Title of the rigorous thesis: Optimization of procedure for isolation of phosphorylated peptides from a peptide mixture by metal oxide affinity chromatography for mass spectrometry analysis. Protein phosphorylation is the key regulatory mechanism in cellular signalling. It is involved in most cellular processes that are regulated by a complex interplay of protein kinases and protein phosphatases and include proliferation, differentiation, and apoptosis. Defective or altered signalling pathways can lead to various diseases, and therefore it is very important to study protein phosphorylation in detail and try to understand it as much as possible. Technological development of mass spectrometry (MS) in recent years has enabled a significant increase in the number of phosphorylation sites that may be identified in a sample. Increasing scan speed together with commercial availability of high resolution MS have improved quantity and quality of the acquired data, which can be obtained in a relatively short time. However, even high-end devices would not allow to comprehensively identify the...