Original title: Molekulární biologie a ekologie rozkladu rostlinných biopolymerů v lesních ekosystémech mikroorganismy
Translated title: Molecular biology and ecology of microbial decomposition of plant-derived biopolymers in forest ecosystems
Authors: Žifčáková, Lucia ; Baldrian, Petr (advisor) ; Uhlík, Ondřej (referee) ; Bárta, Jiří (referee)
Document type: Doctoral theses
Year: 2017
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
The abilities of fungi and bacteria to degrade simple and complex carbon compounds derived from different sources, such as root exudates, litter, soil organic matter or fungal mycelium were studied in this dissertation. Knowledge of functional traits, especially degradation abilities of fungi and bacteria, are important for deciphering the black box of microbial functioning in topsoil and thus aiding in modeling and predicting future directions of microbial communities development in face of global changes. Among fungal cultures form culture collection representing strains with different taxonomy and ecophysiology, the ecophysiology of fungi was more important in manifestation of functional traits than taxonomy. Among bacterial isolates from the litter and soil of spruce forest, Acidobacteria were confirmed to express multiple decomposition enzymes in high rates in vitro and were also abundant and active degraders in acidic spruce forest soil. The expression of degradation capacities of both bacteria and fungi were further studied in situ in spruce forest topsoil, that represents an important environment due to the ubiquity of coniferous forests on the Northern hemisphere. There is an obvious gap of knowledge, when comes to our understanding of seasonal effect on microbial functioning, and this is... V této dizertační práci byly studovány schopnosti hub a bakterií degradovat jednoduché i složité uhlíkaté sloučeniny získané z různých zdrojů, jako jsou kořenové exsudáty, opad, půdní organická hmota nebo houbové mycelium. Znalost funkčních vlastností, zejména degradačních schopností hub a bakterií, je důležitá pro dešifrování černé skříňky fungování mikrobů v půdě, a tím pomáhá při modelování a předpovídání budoucích směrů vývoje mikrobiálních společenstev tváří v tvář globálním změnám. U sbírkových kmenů hub s různou taxonomií a ekofyziologií byla ekofyziologie důležitější při projevu funkčních vlastností než taxonomie. U bakteriálních izolátů z opadu a půdy smrkového lesa, bylo potvrzeno, že Acidobakterie produkují širokou škálu enzymů ve velkém množství in vitro, byly také hojně zastoupeny a také aktivní v procesech rozkladu v kyselé smrkové půdě. Exprese degradačních enzymů u bakterií i hub byly dále studovány in situ v půdě smrkového lesa, která představuje důležité životní prostředí vzhledem k širokému rozšíření jehličnatých lesů na severní polokouli. Naše znalosti, pokud jde o pochopení sezónního vlivu na mikrobiální činnost, jsou nedostatečné. To je důvod, proč byl studovaný vliv sezónnosti na transkripci všech funkčních genů u hub a bakterií. Stejné experimentální uspořádání bylo použito...
Keywords: bacteria; cellulose; decomposition; ecology; forest ecosystems; fungi; molecular biology; plant biopolymers; bacteria; cellulose; decomposition; ecology; forest ecosystems; fungi; molecular biology; plant biopolymers

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/16935

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-492966


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Doctoral theses