Název:
Molekulárně-dynamické simulace biomolekul
Překlad názvu:
Molecular dynamics simulations of biomolecules
Autoři:
Naništa, Ján ; Barvík, Ivan (vedoucí práce) ; Bok, Jiří (oponent) Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok:
2012
Jazyk:
cze
Abstrakt: [cze][eng] Práce se zabývá klasickými molekulárně-dynamickými simulacemi časového vývoje biomolekulárního systému. Modelovým systémem je membránový GPCR receptor pro dopamin typu D3 obklopený buněčnou membránou a vodní obálkou s ionty. Cílem bylo postihnout vazebnou schopnost Eticlopridu do aktivního místa GPCR receptoru.This study deals with classical molecular dynamics simulations of time evolution of a biomolecular system. The simulated system consists of the D3 GPCR membrane receptor for dopamine surrounded by a cell membrane and covered with water molecules and ions. The aim was to analyze the ability of Eticlopride to bind into the active site of the GPCR receptor.
Klíčová slova:
Dopamine; Eticlopride; GPCR; Molekulární dynamika; Dopamine; Eticlopride; GPCR; Molecular dynamics