Original title: Kultivace viru KE \kur{in vivo} v přítomnosti inhibitoru glykosylace: vliv na nukleotidovou sekvenci genů virových proteinů.
Translated title: Cultivation of tick-borne encephalitis virus in the presence of inhibitor of glycosylation: its effect on nucleotide sequence of genes encoding viral proteins.
Authors: FARKOVÁ, Karolína
Document type: Bachelor's theses
Year: 2008
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
V mé práci jsem porovnávala nukleotidovou sekvenci virových genů a výslednou aminokyselinovou sekvenci virových proteinů viru klíšťové encefalitidy varianty Hypr3TM s původní variantou viru Hypr50/CB. Identifikovala jsem čtyři nukleotidové záměny; tři z nich způsobovaly změnu v aminokyselinové sekvenci. Po porovnání s málo pasážovanou variantou Hypr5 se tři z těchto změn shodovaly s touto variantou. Jedna aminokyselinová záměna je unikátní pro variantu Hypr3TM. Tato záměna způsobila změnu v elektrostatickém potenciálu receptorové domény proteinu E, což může ovlivnit proteinové interakce v homodimerech a homotrimerech na povrchu proteinu a interakce proteinu E s receptorem pro virus KE na hostitelské buňce. In this work I compared nucleotide sequences of virus genes and the resulting aminoacid sequences of viral proteins of TBE virus variant Hypr3TM with the parental virus Hypr50/CB. This comparison serves for identification of nucleotide/aminoacid substitutions resulting for virus replication in an enviroment with inhibited protein glycosylation. I identified four nucleotide substitutions; three of them caused also changes in amino acid sequence. When compared to a low-passaged variant Hypr5, three of the nucleotide substituions were identical with this variant. One amino acid substitution is unique for variant Hypr3TM. This substitution caused changes in electrostatic potencial of receptor domain of protein E and thus can affect the protein-protein interactions within homodimers and homotrimers at the surface of the protein and the interaction of the E protein with host-cell receptors for the TBE virus.
Keywords: glycosylation; Tick-borne encephalitis; glykosylace; virus klíšťové encefalitidy
Citation: FARKOVÁ, Karolína. Kultivace viru KE \kur{in vivo} v přítomnosti inhibitoru glykosylace: vliv na nukleotidovou sekvenci genů virových proteinů.. České Budějovice, 2008. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Institution: University of South Bohemia in České Budějovice (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Original record: http://www.jcu.cz/vskp/9754

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-48918


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > University of South Bohemia in České Budějovice
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses