Original title: Analýza aDNA ze zubů a kosterního materiálu s využitím miniSTR lokusů.
Translated title: Ancient-DNA analysis of teeth and skeletal remains with utilization of miniSTR loci.
Authors: Kvítková, Dana ; Brouček, Jaroslav (advisor) ; Dobisíková, Miluše (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2010
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Během uplynulých dvaceti let došlo v oblasti analýzy DNA z historického materiálu k nesmírnému pokroku. Tato analýza se vzhledem k možnostem zachování jednotlivých tkání provádí především ze vzorků získaných z kostí a zubů. Výjimečně je možná analýza měkké mumifikované tkáně. Limitujícími faktory těchto analýz je vysoký stupeň degradace a malé množství DNA izolované z tohoto materiálu. První výzkumy byly zaměřeny pouze na krátké úseky především mitochondriální DNA. Dnes je již možná analýza celých mitochondriálních genomů současných i vyhynulých druhů živočichů. V případě analýz prováděných z lidských ostatků jsou mnohem cennější úseky jaderné DNA, které nám mohou pomoci určit pohlaví jedince, ale i možné příbuzenské vztahy jedinců pocházejících například z jednoho hrobu. Zásadním krokem celé analýzy DNA je její extrakce z buněk. V každé laboratoři, kde se pracuje s historickou DNA, využívají pravděpodobně jinak modifikovaný extrakční protokol. Hlavním požadavkem na extrakční metody je to, aby poskytovaly DNA v takovém množství a čistotě, aby mohla být využita během dalších kroků analýzy. Vzhledem k vysoké fragmentaci DNA je nutné tomuto faktu přizpůsobit všechny kroky analýzy - především její izolaci a amplifikaci. V neposlední řadě je důležité během práce (nejen) s historickou DNA dodržovat... During the last twenty years, immense progress occurred in the area of analysis of DNA extracted from historical material. Considering the common level of preservation of tissue material, this analysis is usually executed on samples procured from bones and teeth. The analysis of soft mummified tissue is possible only in rare cases. Limiting factor of these analyses is a high degree of degradation and small amount of DNA extractable from this kind of material. First researches concentrated only on short sections of mainly mitochondrial DNA. Today, the analysis of the complete mitochondrial genome of both contemporary and extinct organisms was made possible. In case of analyses conducted on human remains, sections of nuclear DNA are far more valuable, because they can reveal information including not only subject's sex, but also possible kinship between subjects found e.g. in the same grave. Fundamental component of the whole analysis is the process of extracting DNA from cells. Probably every laboratory working with historical DNA uses a differently modified extract protocol. The main requirement for methods of extraction is to secure enough DNA with such a level of purity that would allow its use for following steps of the analysis. Taking in consideration high fragmentation of DNA, it is necessary...
Keywords: bone; historical DNA; miniSTR; silica based extraction; teeth; adsorpce na silikát; historická DNA; kost; miniSTR; zub

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/31423

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-479005


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses