Original title: Analýza aminokyselinové větve biosyntetické dráhy antibiotika linkomycinu
Translated title: Analysis of the gene lmbX included propylproline biosynthesis
Authors: Smutná, Yvona ; Najmanová, Lucie (referee)
Document type: Rigorous theses
Year: 2010
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Analýza aminokyselinové větve biosyntetické dráhy antibiotika linkomycinu Abstrakt Linkomycin a jeho deriváty jsou svými antibiotickými vlastnostmi využitelné v humánní i veterinální medicíně k léčbě infekcí způsobených grampozitivními patogeny. Molekula linkomycinu se skládá ze dvou podjednotek, a to methyllinkosamidu a propylprolinu, spojených peptidovou vazbou. Cílem práce bylo přiřadit gen lmbX k biosyntetické dráze propylprolinu, založeném na inaktivačních pokusech. Gen lmbX byl inaktivován pomocí technologie REDIRECT: PCR targeting system in Streptomyces coelicolor. Pro inaktivaci byl vybrán kmen S. lincolnensis, na němž bylo testováno, zda po inaktivaci produkuje do fermentačního média LM pomocí UPLC analýzy. Zastavená produkce LM byla poté obnovena obohacujícím experimentem. Bylo prokázáno, že uvedeným postupem došlo k inaktivaci genu a produkce LM byla potlačena. Obohacujícím experimentem PPL byla produkce LM obnovena a byl gen lmbX přiřazen k biosyntéze PPL. Analysis of the gene lmbX included propylproline biosynthesis Abstract Lincomycin and its derivates are potent antibiotics used in human and veterinary medicine, they are antibiotics exibiting biological activity against Gram-positive bacteria. Lincomycin molecule is composed of two amide-bonded subunits, methylthiolincosamide and propylproline. The aim of the study was to assign the gene lmbX to the propylproline biosynthesis based on gene inactivation experiments. The gene lmbX was inactivated by help of REDIRECT technology: PCR targeting system in Streptomyces coelicolor. The respective S. lincolnensis inactivants were checked for lincomycin production by means of biological test and UPLC analysis of their fermentation broth and then exploited in feeding experiments. It was found, that inactivation of the lmbX gene caused suppression of the lincomycin production which was restored upon PPL feeding therefore the respective gene was assigned to reaction of PPL branch of LM biosynthesis.
Keywords: gene knock out; lincomycin; lmbX; propylproline; Streptomyces lincolnensis

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/32902

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-475701


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Rigorous theses