Original title: Inhibitory Kunitzova typu u Eudiplozoon nipponicum
Translated title: Kunitz-type inhibitors in Eudiplozoon nipponicum
Authors: Černíková, Markéta ; Mikeš, Libor (advisor) ; Jedličková, Lucie (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2021
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Proteiny obsahující Kunitz domény jsou nejčastěji inhibitory serinových proteáz. Jejich obecnou charakteristikou je přítomnost tří disulfidových vazeb a relativně malá velikost kolem 6-10 kDa, ale nezřídka se objevují velké proteiny s několika Kunitz doménami nebo jsou tyto domény součástí komplexnějších proteinů. Jejich funkce obvykle souvisí s regulací fyziologických a proteolytických procesů, ale i s interakcí s patogeny nebo jinými obrannými mechanismy, např. jako součást hlenu sasanek nebo jedu hadů a jiných bezobratlých živočichů. Zaměřili jsme se na Kunitz proteiny u Eudiplozoon nipponicum, parazita třídy Monogenea ze žaber kapra obecného (Cyprinus carpio). V transkriptomu tohoto parazita bylo identifikováno na základě podobnosti s již popsaným Kunitz proteinem EnKT1 několik dalších podobných sekvencí, z čehož lze usuzovat, že tento parazit využívá pro svou specifickou potravní strategii, podobně jako i jiní krevsající paraziti, celou sadu inhibitorů serinových proteáz s různými konkrétními funkcemi. Pomocí PCR bylo několik sekvencí s Kunitz doménou nalezených v transkriptomu ověřováno a případně doplněno pomocí RACE-PCR. Jeden protein, nazvaný EnKC1, byl následně produkován rekombinantně expresí v buňkách bakterie E. coli kmenů SHuffleTM a Rosetta Gami B. U rekombinantního proteinu s Kunitz... Proteins containing Kunitz domain are mostly inhibitors of serine proteases. Their general characteristic is the presence of three disulfide bonds and small sizes around 6-10 kDa, although sometimes they consist of several Kunitz domains or they are part of more complex proteins. Their function is usually related to the regulation of physiological and proteolytic processes, but also to an interaction with pathogens or other defense mechanisms, such as being part of the sea anemone mucus or the venom of snakes and other invertebrates. We focused on Kunitz proteins in Eudiplozoon nipponicum, a helminth of the class Monogenea parasiting on gills of common carp (Cyprinus carpio). In the transcriptome of this parasite, several sequences with Kunitz domain have been identified based on similarities with the one already described Kunitz protein, EnKT1, suggesting that this parasite, like other bloodfeeding parasites, uses a whole set of these serine protease inhibitors with other specific functions. Several sequences with the Kunitz domain found in the transcriptome were verified by PCR and optionally supplemented by RACE-PCR. One protein, called EnKC1, was subsequently produced by recombinant expression in E. coli cells of SHuffleTM and Rosetta Gami B strains. Recombinant protein with the Kunitz domain...
Keywords: anticoagulant; chymotrypsin; Diplozoidae; factor X; inhibitor; Kunitz; peptidase; protease; recombinant protein; antikoagulant; chymotrypsin; Diplozoidiae; faktor X; inhibitor; Kunitz; peptidáza; proteáza; rekombinantní protein

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/150847

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-451990


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses