Original title: Diverzita a fylogeneze metopidních nálevníků patřících do skupiny IAC
Translated title: The diversity and phylogeny of metopid ciliates of the IAC group
Authors: Pomahač, Ondřej ; Čepička, Ivan (advisor) ; Sojková, Pavla (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2021
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Skupina IAC (Armophorea: Metopida: Metopidae) zahrnuje volně žijící i endosymbiotické anaerobní nálevníky. Tato práce se věnuje diverzitě volně žijících zástupců, tzv. metopidům. Nejprve zasazuje skupinu IAC do systému a probírá historii taxonomie stěžejního druhu Metopus. Představuje známou diverzitu a nepřehlednou taxonomickou situaci. V rámci průzkumu diverzity se podařilo zajistit z různých anaerobních habitatů a lokalit více než 30 izolátů ze skupiny IAC. Provedená fylogenetická analýza skupiny IAC je založena na genu pro 18S rRNA a ukazuje bohatou diverzitu nových linií. Vedle skupiny IAC je prezentována ještě jedna linie nově nalezených metopidů. Pro morfologickou charakteristiku byla využita světelná mikroskopie včetně barvicích technik a skenovací elektronová mikroskopie. Práce se detailně věnuje popisu jedné vybrané linie na úrovni druhu. V obsáhlejší diskuzi jsou interpretovány výsledky, poukázáno na meze zvolených metod a rozplétána chaotická situace dosud popsaných druhů skupiny IAC s návrhy na řešení pro budoucí taxonomickou praxi při popisu metopidů. The IAC group (Armophorea: Metopida: Metopidae) includes both free-living and endosymbiotic anaerobic ciliates. The thesis focuses on the diversity of free-living representatives, the so-called metopids. First, the position of the IAC group in the system is explained and the history of the taxonomy of the core species Metopus is presented. Then the taxonomic confusion surrounding this group is depicted. For diversity research more than 30 isolates from the IAC group were obtained from various anaerobic habitats and localities. The phylogenetic analysis of the IAC group is based on the 18S rRNA gene and shows a rich diversity of new lineages. In addition to the IAC group, another newly-found lineage of metopids is presented. Light microscopy, including staining techniques and scanning electron microscopy, was used to establish morphological characteristics. In the work, a detailed description of one selected lineage at the species level is performed. In the discussion, the results are interpreted, the limitations of the selected methods are pointed out and the chaotic taxonomic and phylogenetic situation of the IAC group species described. Suggestions for the improvement of future taxonomic practices in the description of metopids are offered.
Keywords: anaerobic ciliates; diversity; IAC group; Metopus; taxonomy; anaerobní nálevníci; diverzita; Metopus; skupina IAC; taxonomie

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/150887

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-451890


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses