Original title: Příprava peptidů inhibujících interakci PA-BP1 chřipkové RNA polymerasy
Translated title: Synthesis of peptidic inhibitors targeting PA-PB1 interface of influenza RNA polymerase
Authors: Palacková, Miroslava ; Machara, Aleš (advisor) ; Veselý, Jan (referee)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2018
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Tato bakalářská práce se zabývá přípravou peptidů inhibujících protein-proteinovou interakci PA-PB1 podjednotek vyskytující se v chřipkové RNA polymeráze. Cílem práce bylo provést modifikace objeveného minimálního peptidu na dvou tzv. "hot spotech" - místech, které nejvíce přispívají k interakci tohoto hexapeptid s PA podjednotkou. Nejprve byl modifikován hot spot A, čímž vznikla první řada produktů a následně byl optimalizován i druhý hot spot B. Tímto postupem byly připraveny dvě série peptidů. S ohledem na skutečnost, že jeden z připravených hexapeptidů obsahoval komerčně nedostupnou aminokyselinu, musela tato aminokyselina být připravena. Dále se bakalářská práce zabývá přípravou bicyklického peptidu obsahující sekvenci inhibitoru a zároveň i peptidickou sekvenci, jenž umožňuje průchod peptidu přes buněčnou membránu. Klíčová slova: syntéza, peptidy, inhibitory, chřipka, polymerasa The submitted Thesis deals with preparation of a hexapeptides inhibiting protein-protein interaction of PA-PB1 subunits of influenza RNA polymerase. Crucial part of the Thesis represent modifications of particular small hexapeptide at its two "hot spots". It means at positions that significantly contribute to the binding of both subunits. These modifications resulted in preparation of two series of distinct hexapeptides. With regards to the fact that one designed hexapeptide contains unnatural and commercially unavailable amino acids this amino acid had to be prepared from simple building blocks. Apart from aforementioned work the Thesis also covers effort to prepared bicyclic peptide that contains sequences of peptidic inhibitor of protein-protein interactions and also cell-penetration peptide. Key words: synthesis, peptides, inhibitors, influenza, polymerase
Keywords: influenza; inhibitors; peptides; polymerase; synthesis; chřipka; inhibitory; peptidy; polymerasa; syntéza

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/102367

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-451163


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses