Original title: Úloha lipidů a enzymů metabolizujících lipidy v procesu autofagie u rostlin
Translated title: The Role of Lipids and Lipid Metabolizing Enzymes in Plant Autophagy
Authors: Krupař, Pavel ; Martinec, Jan (advisor) ; Hála, Michal (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2021
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
Plant autophagy is a crucial evolutionary conserved process for recycling cytoplasmic material under stress conditions or during development. The autophagic pathway is negatively regulated by TOR kinase, a versatile molecule modulating a wide range of cellular processes. In mammals, TOR kinase may be activated by phosphatidic acid, a vital signalling lipid. This thesis aims to prove the possible involvement of phospholipids in plant autophagy. I analysed the rate of primary root inhibition in knock-out mutants coding phospholipases in A. thaliana with induced autophagy, measured activity of lipid metabolising enzymes in wild type and atg10 mutant and observed autophagosome formation in selected mutants. Autophagosomes were labelled by fluorescent protein in vivo and by indirect immunolabelling in fixed samples. Using advanced stereological approach, I optimized a method for obtaining an unbiased estimate of autophagosome number in plant root cells. Autofagie u rostlin je klíčový, evolučně konzervovaný proces umožňující recyklaci cytoplazmatických komponent během stresových podmínek, či vývoje rostliny. Autofagická dráha je negativně regulována TOR kinasou, univerzální molekulou, která řídí široké spektrum buněčných procesů. V savčích buňkách může být TOR kinasa aktivována kyselinou fosfatidovou, důležitým signálním lipidem. Tato diplomová práce si klade za cíl odhalit možnou roli fosfolipidů v procesu autofagie u rostlin. Byla analyzována inhibice růstu primárního kořene rostlin s vyřazenými geny kódující fosfolipasy u A. thaliana, měřena aktivita enzymů metabolizujících lipidy v rostlinách divokého typu a s vyřazenou autofagií, a také byla pozorována tvorba autofagozomů u vybraných mutantních rostlin. Autofagozomy byly vizualizovány pomocí fluorescenčního proteinu in vivo a nepřímého imunoznačení ve fixovaných preparátech. Za použití pokročilých stereologických postupů byla optimalizována metoda pro získání nevychýleného odhadu počtu autofagozomů v buňkách kořene rostlin.
Keywords: phospholipids; plant autophagy; stereology; autofagie rostlin; fosfolipidy; stereologie

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/126220

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-446015


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses