Original title: Role komplexu Smc5/6 při DNA virové infekci
Translated title: The role of the Smc5/6 complex in DNA viral infection
Authors: Protivová, Eliška ; Huerfano Meneses, Sandra (advisor) ; Pokorná, Karolína (referee)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2021
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Komplex Smc5/6 je eukaryotický proteinový komplex, který se spolu s kohezinem Smc1/3 a kondenzinem Smc2/4 podílí na zajištění stability genomu. K tomu přispívá svou účastí při organizaci a udržování chromozomových struktur a také při odpovědi na poškození DNA. Mimo to bylo zjištěno, že komplex Smc5/6 hraje významnou roli při virové infekci. Tato práce se zaměřuje na mechanismy interakce komplexu Smc5/6 s virovými DNA genomy, DNA intermediárními genomy a virovými proteiny. V případě HBV z čeledi Hepadnaviridae působí Smc5/6 jako restrikční faktor. Stejně je tomu tak u HSV-1 z čeledi Herpesviridae, virů z čeledi Papillomaviridae a HIV-1 z čeledi Retroviridae. Také byla objevena interakce komplexu Smc5/6 s JC virem z čeledi Polyomaviridae. Význam této interakce však zůstává nepochopen. Některé z výše zmíněných virů dokážou této restrikci zabránit. Konkrétně HBV protein HBx zprostředkovává proteazomální degradaci komplexu Smc5/6 či HIV-1 protein Vpr indukuje degradaci proteinu SLF2, který je zodpovědný za lokalizaci komplexu Smc5/6 na DNA intermediární genom HIV-1. Klíčová slova: komplex Smc5/6, oprava DNA, ATPáza, sumoylace, DNA viry, viry s DNA intermediárním genomem, inhibice, restrikční faktor The Smc5/6 complex is an eukaryotic protein complex that, together with Smc1/3 cohesin and Smc2/4 condensin, is involved in ensuring genome stability. It contributes to this by participating in the organization and maintenance of chromosomal structures as well as in the response to DNA damage. In addition, the Smc5/6 complex has been shown to play an important role in viral infection. This thesis focuses on the mechanisms of interaction of the Smc5/6 complex with viral DNA genomes, DNA intermediate genomes and viral proteins. In the case of HBV of the Hepadnaviridae family, Smc5/6 acts as a restriction factor. The same is true for HSV-1 of the Herpesviridae family, viruses of the Papillomaviridae family and HIV-1 of the Retroviridae family. An interaction of the Smc5/6 complex with the JC virus of the Polyomaviridae family has also been discovered. Nevertheless, the meaning of this interaction remains elusive. Some of the above-mentioned viruses can prevent this restriction. In detail, HBx protein of HBV mediates proteasomal degradation of the Smc5/6 complex or Vpr protein of HIV-1 induces degradation of the SLF2 protein, which is responsible for the Smc5/6 localization on HIV-1 DNA intermediate genomes. Keywords: Smc5/6 complex, DNA repair, ATPase, sumoylation, DNA viruses, viruses with a DNA...
Keywords: 6 complex; APTase; DNA repair; DNA viruses; inhibition; restriction factor; Smc5; sumoylation; viruses with a DNA intermediate genome; 6; ATPáza; DNA viry; inhibice; komplex Smc5; oprava DNA; restrikční faktor; sumoylace; viry s DNA intermediárním genomem

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/126221

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-445929


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses