Original title: Struktura, vývoj a funkce mikrobiálních společenstev v odumřelém dřevě
Translated title: Assembly, successional development and functioning of microbial communities in deadwood
Authors: Bernardová, Natálie ; Brabcová, Vendula (advisor) ; Kopecký, Jan (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2020
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Mrtvé dřevo představuje jeden z nejvýznamnějších rezervoárů uhlíku v lesních ekosystémech. V přirozených lesích je jeho objem vyšší, počítaný na řádově stovky m3 ha-1 , zatímco v hospodářských lesích je jeho objem stanovován pouze v desítkách m3 ha-1 . Na rozdíl od rostlinného opadu nebo půdy, je mrtvé dřevo v prostoru nerovnoměrně rozloženo a má specifické fyzikálně-chemické vlastnosti: vysoký obsah těžce rozložitelných polymerů, nízké množství dusíku a je nepropustné. Tyto vlastnosti negativně ovlivňují rychlost rozkladu, zvláště v jeho počátečních fázích. Díky těmto vlastnostem dochází k jeho velmi pomalému rozkladu mikroorganismy, kumuluje se, a proto představuje hlavní rezervoár živin. Tato diplomová práce je zaměřena na popis struktury, vývoje a funkce houbového společenstva v mrtvém dřevě rozkládajícího se v přirozeném bezzásahovém lese a analýzu některých funkčních vlastností hub podílejících se na rozkladu dřeva. Současně byly popsány změny ve fyzikálně-chemických vlastnostech dřeva jako je pH, obsah uhlíku a dusíku v jednotlivých druzích studovaných stromů, ve 4 věkových třídách - stádiích rozkladu. Pro charakterizaci houbového společenstva na základě ITS2 byla použita metoda sekvenace nové generace (NGS) na platformě Illumina MiSeq. Pro analýzu funkčních vlastností byly houby z tlejících... Dead wood is one of the most important reservoirs associated with forest ecosystems. In natural forests, its volume is counted in hundreds of m3 ha-1 , whereas it reaches only tens of m3 ha-1 in productive commercial forests. In contrast to soil and plant litter, deadwood is unevenly distributed on the forest floor. The specific physicochemical properties such as high content of recalcitrant polymers, low nitrogen level and impermeability negatively affect the rate of decomposition especially in the initial stages of wood deconstruction. The deadwood decomposition is very slow in comparisons with other substrates, it accumulates and thus it represents the important reservoir of nutrients. This thesis is focused on the structure, development and function of microbial (fungal) community in decomposing deadwood in unmanaged forest. Functional screening of fungi isolated from fruit bodies collected from coarse deadwood was set aside. Physico-chemical properties of deadwood including pH, carbon and nitrogen content and microbial biomass were estimated for four wood decomposition stages and three different tree species. New generation sequencing (Illumina MiSeq platform) was applied for fungal community structure analysis based on ITS2 fragment. Fungal functional screening was based on physico-chemical...
Keywords: deadwood; decomposition; forest ecosystem; ITS; microbial communities; next-generation-sequencing; soil organic matter; wood decomposing fungi; dekompozice; dřevokazné houby; Ilumina MiSeq sekvenování; ITS; lesní ekosystém; mikrobiální společenstva; rozklad organické hmoty; tlející dřevo

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/119736

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-434014


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses