Original title:
Konstrukce mutantních enzymů pro degradaci antropogenních polutantů
Authors:
Kratochvíl, Jakub Document type: Master’s theses
Year:
2018
Language:
cze Abstract:
[cze][eng] Enzymy jsou přírodní katalyzátory obrovské škály chemických reakcí a jsou vyhledávány jako ekologičtější a ekonomicky méně nákladné alternativy k běžným katalyzátorům používaným v průmyslových odvětvích od bioremediací až po aplikace v lékařství a farmacii. Mezi takovéto enzymy patří i halogenalkandehalogenázy, které katalyzují hydrolýzu halogenovaných sloučenin na odpovídající alkoholy, halogenidové ionty a protony. Přirozeně se vyskytující halogenalkandehalogenázy však mají funkční omezení a pro průmyslové aplikace nejsou dosud vhodné. Zde se dostávají ke slovu metody řízené evoluce nebo racionálního designu jako efektivní strategie pro vytváření ge-netické rozmanitosti a získání nových variant enzymů s požadovanými vlastnostmi. V této práci byla metodami proteinového inženýrství modifikována halogenalkandehalogenáza DhaA31 s cílem vylepšit její katalytické parametry vůči antropogennímu polutantu 1,2,3-trichlorpropanu.Právní doložka:Prosím o odložení zveřejnění materiálů a metod, výsledků a závěrů diplomové práce na dobu 3 let. Tyto výsledky jsou součástí projektu, který ještě nebyl publikován.Enzymes are naturally occurring catalysts with a broad spectrum of catalysed chemical reactions, and they therefore represent environmentally-friendly and economically costeffective tools in many industrial processes, bioremediation, biomedical and pharmacological applications. Among such biocatalysts belong haloalkane dehalogenases (HLDs), which catalyse the cleavage of the carbon-halogen bond of halogenated compounds, resulting in corresponding products – alcohols, halide ions and protons. Howe-ver, catalytic properties of naturally occurring HLDs very often do not fulfill reqirements of industrial applications which limits their practical potential. Methods of directed evolution and ratoional design are therefore often used to generate genetic diversity and cosntruct novel protein varaits with deired function. In this work, a protein engineering strategy was applied to improve catalytic parameters of haloalkane dehalogenase DhaA31 towards anthropogenic pollutant 1,2,3-trichloropropane.Formula clause:Please postpone publication of materials, methods, results and conclusions of this thesis for a period of 3 years. These results are part of a project that has not yet been published.
Keywords:
enzymy; halogenalkandehalogenáza; proteinové inženýrství; racionální design; řízená evoluce