Original title:
Variabilita genů IGFBP2 a MC4R ve vztahu ke kvalitě masa prasat
Authors:
Steinerová, Michala Document type: Master’s theses
Year:
2018
Language:
cze Abstract:
[cze][eng] Předmětem diplomové práce bylo provedení asociační analýzy vybraného jednonukleotidového polymorfismu genu IGFBP-2 a MC4R u vybraného souboru prasat plemene české bílé ušlechtilé se znaky charakterizující kvalitu vepřového masa. Vybranými znaky byla hodnota pH, barva masa, elektrická vodivost, ztráta vody odkapem, obsah intramuskulárního tuku a mastných kyselin. Pro detekci polymorfismů byly využity metody PCR a RFLP. Byla vypočítána frekvence alel a genotypů a výsledky byly vyhodnoceny pomocí programu SAS. V případě genu IGFPB-2 byla ve sledovaném souboru zvířat zjištěna vyšší četnost alely B (99,5 %), relativní frekvence genotypu BB byla 99 %, AB 1 % a genotyp AA se v populaci nevyskytoval. Z tohoto důvodu nemohla být provedena asociační analýza. U genu MC4R vykazovala vyšší četnost alela G (74,52 %), přičemž relativní frekvence genotypů AA byla 2,88 %, AG 45,19 % a GG 51,92 %. Na základě asociační analýzy byl prokázán statisticky průkazný rozdíl při hladině průkaznosti P ≤ 0,05 na obsah kyseliny linolové mezi genotypy AG×GG a na ztrátu vody odkapem, kde byl rozdíl mezi genotypy AA×GG. U ostatních ukazatelů nebyl zjištěn statisticky průkazný rozdíl, a to ani rozdíl blížící se průkaznosti (P ≤ 0,1).The aim of this diploma thesis was association analysis of single nucleotide polymorphism of IGFBP-2 and MC4R genes in a selected group of Czech Large White pigs with indicators of pork quality. The surveyed traits were pH value, color of meat, electrical conductivity, drip loss, contents of intramuscular fat and fatty acids. The polymorphisms were detected by the PCR and RFLP procedures. The allele and genotype frequencies were calculated and results were statistically evaluated using SAS program. In the case of the IGFBP-2 gene was discovered, that the observed set of animals is marked out by the higher percentage of allele B (99,5 %), the relative frequency of the BB genotype was 99 %, AB 1 % and genotype AA has not been found. For this reason, an association analysis could not be performed. The MC4R gene showed a higher frequency of the G allele (74.52%), with the relative frequency of AA genotypes being 2.88%, AG 45.19% and GG 51.92%. On the basis of the association analysis, statistically significant differences were found in the content of the linoleic acid at significance level of P ≤ 0,05 between genotypes AG×GG and to the drip loss where was the difference between the genotypes AA×GG. No statistically significant differences were found for other meat quality indicators, not even value close to significant difference (P ≤ 0,1).
Keywords:
IGFBP-2; kvalita vepřového masa; MC4R; polymorfismus
guest ::
