Název:
Implementace nástroje pro analýzu lokálních struktur DNA
Překlad názvu:
Implementation of local DNA structures analysis tool
Autoři:
Kaura, Patrik ; Trenz, Oldřich (oponent) ; Šťastný, Jiří (vedoucí práce) Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok:
2019
Jazyk:
cze
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta strojního inženýrství
Abstrakt: [cze][eng]
Tato diplomová práce je zaměřena na popis a realizaci aplikace API wrapper, která pracuje nad výpočetním jádrem ibp bioinformatics. První polovina práce se zaměřuje na shrnutí základních znalostí z oblasti výzkumu DNA, rovněž i specifikaci problému a popisu zvolených technologií. Druhá polovina se soustředí na samotnou realizaci, distribuci a vyhodnocení použitelnosti aplikace na konkrétních sekvencích DNA.
This diploma thesis is focused on the description and implementation of the API wrapper application, which works on top of computational core ibp bioinformatics. The first half of the thesis is focused on the summary of basic knowledge in the field of DNA research, as well as the specification of the problem and description of selected technologies. The other half deals with the actual implementation, distribution, and evaluation of application applicability on specific DNA sequences.
Klíčová slova:
DNA; guaninový kvadruplex; Jupyter notebook; lokální struktury; pypi; Python; REST API; DNA; guanine quadruplex; Jupyter notebook; local structures; pypi; Python; REST API
Instituce: Vysoké učení technické v Brně
(web)
Informace o dostupnosti dokumentu:
Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT. Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/179104