Original title:
Metodika detekce tří obilných virů (BYDV, WDV, WSMV) pomocí Multiplex TaqMan RT-qPCR
Translated title:
Methodics of detection of three cereal viruses (BYDV, WDV, WSMV) by Multiplex TaqMan RT-qPCR
Authors:
Kumar, Jiban ; Jarošová, Jana Document type: Methods ISBN: 978-80-7427-284-4
Year:
2018
Language:
cze Publisher:
Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i. Abstract:
[cze][eng] Čeleď Poaceae je zemědělsky nejdůležitější čeledí rostlin na světě. Čeleď Poaceae je také hostitelem mnoha patogenů včetně více než sta známých druhů virů. Tři nejdůležitější virové choroby napadající obilniny v ČR jsou virová zakrslost pšenice (WDV), žlutá zakrslost ječmene (BYDV) a čárkovitá mozaika pšenice (WSMV). Tato metodika poskytuje popis způsobu současné detekce a kvantifikace těchto tří virů obilnin a trav v jedné reakci pomocí metody TaqMan RT-qPCR. Metodika může sloužit vědeckým pracovníkům ke studijním účelům i pracovníkům státní správy k monitoringu výskytu jednotlivých virů na území ČR.The family Poaceae is one of the most important groups of plants in the terms of agricultural production. The family Poaceae also hosts many pathogens including >100 known virus species. The three most important viruses affecting cereals in the Czech Republic are Barley yellow dwarf virus (BYDV), Wheat dwarf virus (WDV) and Wheat streak mosaic virus (WSMV). In this methodology we provide an assay for multiplex detection and quantification of those viruses by TaqMan RT-qPCR. The methodology is meant to serve scientific workers as well as the employees of state laboratories as a tool for individual virus occurrence monitoring in the Czech Republic.
Keywords:
cereals; plant viruses; obilniny; rostlinné viry Project no.: TF02000056 (CEP) Funding provider: Technologická agentura České republiky
Rights: This work is protected under the Copyright Act No. 121/2000 Coll.