Original title:
Studium prevalence \kur{Giardia intestinalis}
Authors:
BROŽOVÁ, Kristýna Document type: Bachelor's theses
Year:
2019
Language:
cze Abstract:
[cze][eng] Tento projekt je zaměřen na studium prevalence střevního prvoka, Giardia intestinalis, v lidských a zvířecích vzorcích, a to pomocí dvou diagnostických přístupů: (i) koproskopická diagnostika, konkrétně využitím Sheatherovy flotace, a (ii) PCR. Nejprve byly optimalizovány tři PCR protokoly pro různé geny (triózafosfát-izomeráza, beta-giardin a malá ribozomální podjednotka) gradientovou PCR. Na základě těchto výsledků byl gen TPI vybrán jako nejlepší volba pro molekulární diagnostiku G. intestinalis v odebraných vzorcích stolice a trusu. Giardia byla detekována pouze ve zvířecích vzorcích (2/41, vzorky psa a králíka), zatímco všechny analyzované lidské vzorky zůstaly negativní. Později se ukázalo, že protokol TPI vykazoval nízkou citlivost pro diagnostiku G. intestinalis.The present project is focused on the study of a prevalence of the gut protist, Giardia intestinalis, in human and animal samples using two diagnostic approaches: (i) coproscopical diagnostics, specifically Sheather flotation technique, and (ii) PCR. First, three PCR protocols for different genes (triosephosphate isomerase, beta-giardin and small ribosomal subunit) were optimized by gradient PCR. Based on these result, the gene TPI was chosen as the best option for molecular diagnostics of G. intestinalis in the collected stool and fecal samples. Giardia was detected only in the animal samples (2/41, dog and rabbit samples), all the analysed human samples remained negative. Further, the TPI protocol showed low sensitivity for diagnostics of G. intestinalis.
Keywords:
beta-giardin; fecal sample; giardia; PCR; prevalence; Sheather flotation technique; small ribosomal subunit; stool; triosephosphate isomerase; beta-giardin; giardia; malá ribozomální podjednotka; PCR; prevalence; Sheatherova flotace; stolice; triózafosfát-izomeráza; trus Citation: BROŽOVÁ, Kristýna. Studium prevalence \kur{Giardia intestinalis}. České Budějovice, 2019. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta
Institution: University of South Bohemia in České Budějovice
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Original record: http://www.jcu.cz/vskp/55628