Original title: Detekce a monitoring potenciálně toxických sinicových lipopeptidů
Authors: BÁRTOVÁ, Marie
Document type: Master’s theses
Year: 2019
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Cílem práce bylo designování a optimalizace PCR primerů pro detekci potenciálních sinicových producentů cytotoxických lipopeptidů puwainaphycinů a minutissamidů v environmentálních vzorcích. Na základě předchozích dat byly testovány vzorky ze dvou různých lokalit. První sada odebraných vzorků se skládala ze sinicových půdních biofilmů z pastvin ovcí, postižených onemocněním Alveld v Norsku. Druhá část vzorků obsahuje vzorky planktonních sinicových květů v CHKO Třeboňsko a okolí. Pro hodnocení přítomnosti lipopeptidů sinic byly použity tři různé postupy: mikroskopie, PCR s navrženými primery a analýza kapalinovou chromatografií - hmotnostní spektrometrií. Výsledky této studie potvrdily specificitu nově navržených PCR primerů. Na obou testovaných lokalitách byla prokázána přítomnost producentů puwainaphycinů / minutissamidů. The aim of this study was to design and optimize new PCR primers for detection of potential cyanobacterial producers of cytotoxic lipopeptides puwainaphycins and minutissamides in environmental samples. Samples from two distinct localities were tested, as suggested based on preliminary data. The first set of samples consisted of cyanobacterial soil biofilms from sheep pastures affected by Alveld illness in Norway. The other one contained samples of planktic cyanobacaterial blooms from Protected Landscape Area Třeboň and its vicinity. Three different approaches were used for evaluation of the presence of cyanobacterial lipopeptide producers: microscopy, PCR with the designed primeres, and liquid chromatography-mass spectrometry analysis. Results of this study confirmed the specificity of the newly designed PCR primers. The presence of producers of puwainaphycins/minutissamides was proven at both tested localities.
Keywords: Alveld; biofilm; Cyanobacteria; cyanotoxins; lipopeptides; minutissamides; Norway; PCR; plankton; primers; puwainaphycins; Třeboň; water bloom; Alveld; biofilm; cyanotoxiny; lipopeptidy; minuitissamidy; Norsko; PCR; plankton; primery; puwainaphyciny; Sinice; Třeboň; vodní květ
Citation: BÁRTOVÁ, Marie. Detekce a monitoring potenciálně toxických sinicových lipopeptidů. České Budějovice, 2019. diplomová práce (Mgr.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Institution: University of South Bohemia in České Budějovice (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Original record: http://www.jcu.cz/vskp/50081

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-394171


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > University of South Bohemia in České Budějovice
Academic theses (ETDs) > Master’s theses