Original title:
Redukce pohybových artefaktů v datech BOLD fMRI s využitím eliminace vlivu pohybem postižených skanů
Translated title:
Reduction of movement artifacts in BOLD fMRI data using rejection of motion-corrupted scans
Authors:
Svatoň, Jan ; Gajdoš, Martin (referee) ; Mikl, Michal (advisor) Document type: Bachelor's theses
Year:
2018
Language:
eng Publisher:
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií Abstract:
[eng][cze]
Tato bakalářská práce ze zprvu zabývá elementárními principy magnetické rezonance a zdrojů šumu a artefaktů v datech. Dále práce podrobněji pojednává o pohybovém artefaktu a navrhuje dvě vhodné metody pro lokalizaci a odstranění pohybem postižených skenů BOLD fMRI dat. Metody jsou poté implementovány v prostředí MATLAB a otestovány na vhodných datasetech poskytnutých Laboratoří multimodálního a funkčního zobrazování, CEITEC MU. Nakonec jsou prezentovány a vyhodnoceny výsledky zároveň s doporučením pro vhodný způsob eliminace pohybového artefaktu v datech.
This bachelor thesis first deals with the elementary principles of function magnetic resonance and the sources of noise and artifacts in the data. Furthermore, the thesis elaborates on the motion artifact phenomena and suggests two suitable methods for locating and eliminating motion-affected scans in the BOLD fMRI data. The methods are then implemented in the MATLAB environment and tested on suitable datasets provided by the Multimodal and Functional Imaging Laboratory of CEITEC MU. Finally, the results are presented and evaluated along with a recommendation for a suitable way of eliminating movement artifacts in the data.
Keywords:
BOLD fMRI; motion scrubbing; Obecný lineární model; Pohybový artefakt; spike regression; BOLD fMRI; General Linear Model; Motion artifact; motion scrubbing; spike regression
Institution: Brno University of Technology
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library. Original record: http://hdl.handle.net/11012/82744