Original title:
Teoretické studium interakce derivátů helicenu s DNA
Authors:
KUBELKA, Jiří Document type: Bachelor's theses
Year:
2018
Language:
cze Abstract:
[cze][eng] Tato bakalářská práce se zabývá výzkumem na poli interakcí mezi dvouvláknovou DNA a [6]helicenem a jeho deriváty za použití metod výpočetní chemie, jmenovitě PM6-D3H4X a DFT s funkcionálem BLYP. Zaměřili jsme se na dva hlavní vazebné motivy, tj. interkalace a vazba do malého žlábku a vyhodnocovali jsme jejich interakční energie pomocí metody counterpoise. Vazba je slabě stereospeciická a interkalace je energeticky preferovanější vazebný motiv oproti vazbě do malého žlábku. Kromě toho jsme vyhodnocovali použitelnost semi-empirické metody pro výpočet takovýchto komplexů.This thesis conducts a research on the field of interactions between ds-DNA and [6]helicene and its two derivatives using computational chemistry methods, PM6-D3H4X and DFT (BLYP functional). We focused on two main bonding motifs, i.e. intercalation and groove binding, and we evaluated their interaction energies via counterpoise method. The binding is weakly stereospecific and the intercalation is preferred to groove binding. Besides, we discussed applicability of used semi-empirical method for computing of such complexes. Citation: KUBELKA, Jiří. Teoretické studium interakce derivátů helicenu s DNA. České Budějovice, 2018. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta
Institution: University of South Bohemia in České Budějovice
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Original record: http://www.jcu.cz/vskp/44536