Original title:
Monte Carlo modeling of radiolytic damage of DNA bases
Translated title:
Monte Carlo modelování radiolýzy bází DNA
Authors:
Kozelka, Jakub ; Běgusová, Marie Document type: Papers Conference/Event: Dny radiační ochrany /26./, Luhačovice (CZ), 2004-11-01 / 2004-11-05
Year:
2004
Language:
eng Abstract:
[eng][cze] An attempt to explain differences in measured yields of modified bases determined in free bases and in the double stranded DNA is made with help of theoretical calculations. A theoretical model is applied to predict yields of reactions of the most important radiolytic product, OH• radical, with individual nucleobases, nucleosides and short DNA oligomers. The relation between spatial limitations for radical approach to particular reaction sites within DNA and the yields of damaged bases is discussed.Teoretické výpočty byly použity pro vysvětlení rozdílů v experimentálních výtěžcích poškozených bází stanovených pro volné báze a v dvoušroubovici DNA. Teoretický model byl aplikován pro predikce výtěžků reakcí nejvýznamnějšího produktu radiolýzy, OH• radikál, s bázemi, nukleosidy a krátkými oligomery DNA. Je diskutován vztah mezi prostorovým omezením přístupu radikálů k jednotlivým reakčním místům v DNA a výtěžky poškozených bází.
Keywords:
DNA bases; ionizing radiation; theoretical modeling; water radiolysis Project no.: CEZ:AV0Z1048901 (CEP), KJB4048401 (CEP) Funding provider: GA AV ČR Host item entry: XXVI. Dny radiační ochrany, Sborník rozšířených abstraktů, ISBN 80-01-03076-8
Institution: Nuclear Physics Institute AS ČR
(web)
Document availability information: Fulltext is available at the institute of the Academy of Sciences. Original record: http://hdl.handle.net/11104/0132578