Original title: Význam nabitých reziduí pro aktivaci a modulaci iontového kanálu TRPA1
Translated title: The role of charged residues in the activation and modulation of the TRPA1 ion channel
Authors: Zímová, Lucie ; Vlachová, Viktorie (advisor) ; Doležal, Vladimír (referee) ; Rokyta, Richard (referee)
Document type: Doctoral theses
Year: 2015
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
Important receptor for sensing painful stimuli is ion channel TRPA1, which is expressed in peripheral endings of nociceptive neurons, where it serves as transducer of physical and chemical environmental signals to the language of the nervous system. The effort to understand the mechanisms of its activity on a molecular level is driven by the vision of progress in treatment of chronic pain in humans. Our work focused on C-terminal cytoplasmic domain of TRPA1 receptor, where we described i.a. the probable binding site for calcium, which is the most important TRPA1 modulator. Using the combination of homology modeling and molecular dynamic simulations with electrophysiological measurements we were able to explain molecular basis of familial pain syndrome caused by TRPA1 point mutation. We contributed to the understanding of the TRPA1 voltage-dependent activation mechanism by describing the amino acids in proximal C-terminus and in S4-S5 linker of transmembrane domain that are directly involved in voltage-dependent gating. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org) Důležitým receptorem pro detekci bolestivých podnětů je iontový kanál TRPA1 exprimovaný na periferních zakončeních nociceptivních neuronů, kde slouží k převodu fyzikálních a chemických signálů z okolí na signalizaci nervové soustavy. Snaha porozumět mechanizmům aktivace TRPA1 na molekulární úrovni je vedená snahou najít vhodné přístupy k léčení chronických bolestivých stavů u člověka. Naše práce se zaměřila na C-koncovou cytoplazmatickou doménu TRPA1 receptoru, kde jsme popsali možné vazebné místo pro vápník, který je nejdůležitějším modulátorem TRPA1. Díky kombinaci homologního modelování a molekulárně dynamických simulací s elektrofyziologickým měřením se nám podařilo navrhnout hypotézu, která vysvětluje molekulární podstatu dědičného bolestivého syndromu způsobeného bodovou mutací TRPA1. K objasnění principu napěťové aktivace tohoto receptoru jsme přispěli popisem aminokyselin na proximálním C-konci a v S4-S5 oblasti transmembránové domény, které se na napěťové aktivaci podílí. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
Keywords: C-terminal domain; calcium modulation; structurefunction relationship; Transient receptor potential ankyrin (TRPA); voltage-dependent gating; Ankyrinový receptor (TRPA); C-terminální doména; modulace vápníkem; napěťově závislé vrátkování; strukturně-funkční vztah

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/82645

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-352287


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Doctoral theses