Original title:
Role efluxového systému AdeABC v rezistenci Acinetobacter baumannii k aminoglykosidům
Translated title:
The role of the AdeABC efflux system in resistance of Acinetobacter baumannii to aminoglycosides
Authors:
Kladivová, Lucie ; Nemec, Alexandr (advisor) ; Nunvář, Jaroslav (referee) Document type: Master’s theses
Year:
2014
Language:
cze Abstract:
[cze][eng] Acinetobacter baumannii je významný nemocniční patogen charakterizovaný schopností získávat a vyvíjet komplexní rezistenci k antimikrobním látkám. Na této schopnosti se zásadně podílejí efluxové systémy, které odstraňují molekuly antibiotik z intracelulárního prostoru bakterie. AdeABC je chromozomální efluxový systém typu RND, který je specifický pro A. baumannii a vyznačuje se širokým substrátovým spektrem. V této práci jsme se zaměřili na funkční analýzu systému AdeABC s cílem definovat jeho roli při vzniku rezistence k aminoglykozidům u geneticky odlišných kmenů. Východiskem byl soubor 15 epidemiologicky a genotypově definovaných kmenů A. baumannii, které byly plně citlivé k aminoglykozidům a dalším antibiotikům primárně účinným na tento druh. U těchto kmenů jsme určili genotyp AdeABC a v přítomnosti netilmicinu selektovali rezistentní varianty. Pomocí kvantitativní RT- PCR jsme porovnali expresi transportérového genu adeB u původně citlivých kmenů a selektovaných variant. Získané výsledky potvrzují, že zvýšená exprese AdeABC významně snižuje citlivost k aminoglykozidům a dalším antibiotikům, a naznačují, že tento systém poskytuje nemocničním kmenům A. baumannii významnou selekční výhodu.Acinetobacter baumannii is an important nosocomial pathogen characterized by the ability to acquire and develop complex resistance to antimicrobial agents. This capability is caused by eflux systems removing molecules of antibiotics from bacterial intracellular space. AdeABC is an RND-type chromosomal eflux system specific for A. baumannii which has a broad substrate spectrum. In this work, we focused on functional analysis of AdeABC to define its role in the resistance development to aminoglycosides in genetically different strains. We studied a set of 15 epidemiologically and genotypically well characterized strains of A. baumannii which were fully susceptible to aminoglycosides and other antibiotics primarily effective against this species. We determined genotyp of AdeABC for these strains and performed a selection for resistant variants in the presence of netilmicin. Using real-time qRT-PCR we compared the expression of the transporter gene adeB in originally sensitive strains and selected variants. The obtained results confirmed that the increased expression of AdeABC significantly reduces susceptibility to aminoglycosides and other antibiotics. The results also suggest that the efflux system provides a significant selective advantage for nosocomial strains of A. baumannii.
Keywords:
Acinetobacter baumannii; AdeABC; aminoglycosides; efflux systems; netilmicin; real-time qRT-PCR; resistance; RND; Acinetobacter baumannii; AdeABC; aminoglykozidy; efluxové systémy; netilmicin; real-time qRT-PCR; rezistence; RND
Institution: Charles University Faculties (theses)
(web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository. Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/72251