Original title: SWI2/SNF2 ATPázy se zaměřením na podrodinu ISWI: proteinové komplexy a myší modely pro jejich studium
Translated title: SWI2/SNF2 ATPases with a focus on the ISWI subfamily: protein complexes and mouse models for their study
Authors: Turková, Tereza ; Stopka, Tomáš (advisor) ; Janoštiak, Radoslav (referee)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2014
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
DNA je v buněčném jádře sbalena spolu s proteiny do dynamické struktury zvané chromatin. Během buněčného cyklu podléhá struktura chromatinu výrazným změnám. V interfázi jsou některé jeho části rozvolněny a během buněčného dělení se pak dostává do podoby velmi kondenzovaných mitotických chromozomů. Struktura chromatinu má vliv na genovou expresi. Pro její průběh je nutná vazba proteinů na DNA. Aby byl umožněn přístup DNA vazebným faktorům, chromatin musí být v rozvolněné podobě. Pokud by však byla struktura kondenzovaná, byla by pro DNA vazebné proteiny prakticky nepřístupná. Remodelace struktury chromatinu je tedy jedním z nástrojů ovlivňujících genovou expresi a enzymy, které remodelaci zajišťují, jsou pro buňku velmi důležité. Jedním z nich je ATPáza Smarca5 patřící do proteinové podrodiny ISWI, která tvoří katalytickou podjednotku několika odlišných komplexů remodelujících chromatin v závislosti na ATP. Bylo zjištěno, že mutace ve členech těchto komplexů mají vliv na regulaci transkripce a diferenciace buněk. V některých případech může nesprávná funkce těchto komplexů vést k nádorové transformaci. Tato bakalářská práce je zaměřena na popis funkce jednotlivých komplexů remodelujících chromatin, jejichž podjednotkou je ATPáza Smarca5. Dále jsou zde shrnuty současné myší modely užívané pro výzkum... In the nucleus the DNA is packed along with proteins into a dynamic structure called chromatin. During cell cycle the chromatin structure becomes a subject to various changes. During interphase chromatin structure becomes loose while shortly before cell division it undertakes the form of highly condensed mitotic chromosomes. Structure of chromatin influences significantly mode of gene expression and its pattern. DNA-binding proteins interacting within chromatin are also necessary during this process. To gain the access to the DNA binding factors, the chromatin has to be in a loosened form. As long as the structure of the chromatin is more condensed it creates a barrier for the DNA binding proteins. Therefore it becomes obvious that the remodeling of the chromatin structure is one of the important regulators of gene expression and that the enzymes, which execute remodeling, are of great importance. One of them is ATPase Smarca5, which belongs to the protein subfamily ISWI and which creates the catalytic subunit for several different ATP-dependent chromatin remodeling complexes. Mutations of members of those complexes disturb regulation of transcription and cellular differentiation. In some cases the incorrect function of these complexes can lead to cellular transformation into a tumours state. This...
Keywords: ATP-dependent chromatin-remodeling complexes; Chromatin remodeling; ISWI; mouse models; Smarca5; ISWI; komplexy remodelující chromatin-závislé na ATP; myší modely; Remodelace chromatinu; Smarca5

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/70986

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-340111


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses