Original title:
Fylogenetické studie polyploidního rodu Curcuma L.
Translated title:
Phylogenetic Studies in the Polyploid Genus Curcuma L.
Authors:
Záveská, Eliška ; Fér, Tomáš (advisor) ; Schmickl, Roswitha Elisabeth (referee) ; de Boer, Hugo (referee) Document type: Doctoral theses
Year:
2014
Language:
eng Abstract:
[eng][cze] 1 Phylogenetic Studies in the Polyploid Genus Curcuma L. SUMMARY Curcuma is genetically one of the most complex genera within the tropical family Zingiberaceae, with hybridization and polyploidization being the major forces in its evolution. In this thesis, I have focused mainly on the genetic background of Curcuma species variation, relationships and overall genome structure, as a key to solve long standing taxonomic problems. Results of my molecular studies on the genus Curcuma performed since 2007 represent an extension of ongoing taxonomic and nomenclatural work started by Jana Leong- Škorničková in 2000. The first part of the thesis consists of a broad, general introduction to the subject to reflect the current state of knowledge, formulate the major problems to be confronted within the genus, and summarise the major results of the studies presented in the second part of the thesis. As the main obstacles in studying Curcuma are consequences of its reticulate evolution, it is also outlines the importance of understanding the genetic background and species relationships using molecular markers. Common molecular methods used for assessing phylogenetic relationships on the intraspecific and infrageneric levels - AFLP and sequencing of selected markers from cpDNA, nrDNA and nDNA - are described, with the...1 Fylogenetické studie polyploidního rodu Curcuma L. SOUHRN Tato práce je souhrnem mých dosavadních molekulárních studií rodu Curcuma, které probíhaly od roku 2007, a je těsně propojena s dříve započatými studiemi tohoto rodu z hlediska jeho taxonomie a nomenklatury (Jana Leong-Škorničková, od roku 2000). Rod Curcuma patří díky své obrovské genetické rozmanitosti mezi nejproblematičtější rody v rámci čeledi Zingiberaceae. Velká část této rozmanitosti vznikla díky speciačním procesům jako je hybridizace či polyploidizace. Neboť z povahy hybridizačních (ale i polyploidizačních) procesů jsou druhy rodu Curcuma často provázány síťovitými vztahy (narozdíl od běžných allopatrických speciačních procesů, kdy jeden druh vzniká pozvolným vylišením z jednoho předka), tyto vztahy lze zpětně odhalit zejména za použití tzv. molekulárních markerů. Náplní této práce je odhalení genetických vztahů v rámci rodu Curcuma a v rámci jeho jednotlivých vývojových linií, za účelem objasnění dlouhodobě nevyřešených taxonomickych otázek. První část práce je věnována obecnému úvodu shrnujícímu současný stav poznání rodu Curcuma a předchází části druhé, ve které jsou prezentovány čtyři případové studie. Jsou zde popsány základní charakteristiky rodu Curcuma, zejména znaky morfologické a cytologické, současné geografické rozšíření, či...
Keywords:
AFLP; hybridizace; nesoulad genových fylogenezí; rekonstrukce fylogeneze; sekvenace DNA; AFLP; DNA sequencing; gene tree incongruence; hybridization; phylogeny reconstruction
Institution: Charles University Faculties (theses)
(web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository. Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/69291