Original title:
Molekulárně cytogenetická analýza aberací chromosomu 11 u hematologických malignit
Translated title:
Molecular-cytogenetic analysis of chromosome 11 aberrations in hematological malignancies
Authors:
Šárová, Iveta ; Březinová, Jana (advisor) ; Goetz, Petr (referee) ; Jarošová, Marie (referee) Document type: Doctoral theses
Year:
2013
Language:
cze Abstract:
[cze][eng] Změny chromosomu 11 patří mezi časté cytogenetické nálezy u hematologických malignit. Zlomové místo se obvykle nachází v oblasti 11q23.3, v proto-onkogenu MLL. Vzácně se zlomy vyskytují i v jiných oblastech, což svědčí o účasti i dalších genů. V naší studii jsme se zaměřili na identifikaci zlomů a oblastí amplifikace/delece na chromosomu 11 v buňkách kostní dřeně/periferní krve nemocných s akutní myeloidní leukémií (AML). Na chromosomu 11 jsme identifikovali množství rekurentních i náhodných zlomových míst (rekurentní v genech MLL (11q23.3) a NUP98 (11p15.4) a v oblastech 11p13, 11p12 a 11q13.2) a vyhodnotili jsme deletované a duplikované/amplifikované oblasti. Poukázali jsme na nové kandidátní geny s možnou úlohou v patogenezi AML. Oproti přestavbám MLL genu, jsme prokázali spojitost ostatních změn chromosomu 11 se starším věkem nemocných, komplexním karyotypem, nebalancovanou změnou a krátkou dobou přežití. FISH skríningové vyšetření se ukázalo velmi přínosné u pacientů s nedostatkem dělících se buněk a pro detekci kryptických přestaveb MLL genu. Studium chromosomových změn slouží nejen ke klinické stratifikaci nemocných do prognostických skupin, ale je i nezbytným podkladem pro identifikaci genů, které asociují se vznikem a progresí nádorů. Analýzy těchto genů a jejich produktů nám pomáhají...Chromosome 11 abnormalities are found in many hematological malignancies. In acute myeloid leukemia (AML), a proto-oncogene MLL (11q23.3) is frequently altered. However, rearrangements to other regions of chromosome 11 have been reported. Therefore, we have identified and characterized the chromosome 11 breakpoints and common deleted and amplified areas in the bone marrow or peripheral blood cells of newly diagnosed patients with AML. Many recurrent and random chromosome 11 breakpoints were identified (recurrent in bands 11p15.4 (in NUP98 gene), 11q23.3 (in the MLL gene), 11p13, 11p12 and 11q13.2) and deleted or duplicated/amplified regions were determined. We notified new possibly significant genes in the development of AML. Contrary to the MLL rearrangements, patients with other chromosome 11 changes were older, with complex karyotype, unbalanced aberrations and short survival. FISH screening was proved very helpful in case of deviding cells lack and cryptic MLL gene rearrangement. In conclusion, molecular analyses of chromosomal breakpoints and amplified or deleted areas are very important not only for the patient stratification into specific prognostic and clinical subgroups but also for the identification of genes involved in tumour pathogenesis. Further investigation of the affected genes and...
Institution: Charles University Faculties (theses)
(web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository. Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/61122