Original title: Leukemie s fusním genem BCR/ABL.
Translated title: Leukaemias with BCR/ABL fusion gene.
Authors: Hovorková, Lenka ; Zuna, Jan (advisor) ; Zemanová, Karla (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2013
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Philadelphský (Ph) chromozom je chromozomální aberací, která je nejčastěji spojována s chronickou myeloidní (CML) a akutní lymfoblastickou (ALL) leukémií. Zlomy vedoucí ke vzniku této reciproké translokace vznikají v dlouhých intronových oblastech genů BCR a ABL. Nově vzniklé přechodové oblasti jsou u každého pacienta jedinečné a otevírají tak možnost pro detekci minimální reziduální nemoci (MRN). MRN by měla přinášet informaci o množství leukemických buněk v organismu v průběhu léčby, je důležitým prognostickým faktorem a má vliv na intenzitu léčby. V současné době jsou k tomuto monitoringu využívány dvě standardizované metody. Jsou jimi detekce klonálních přestaveb genů pro Imunoglobuliny a/nebo T-buněčné receptory na genomické úrovni a detekce fúzního genu BCR/ABL na mRNA úrovni. První ze zmíněných metod není v praxi využitelná pro CML pacienty, kteří mají primárně postižené myeloidní buňky, které imunoreceptorové geny nepřestavují. Naším cílem bylo optimalizovat a standardizovat metodu hledání BCR/ABL zlomů na genomické úrovni a využít těchto přechodových sekvencí ke stanovení MRN. Podařilo se nám nalézt přechodovou sekvenci v 80 % případů. Při srovnání hodnot naměřených námi zavedenou metodou s hodnotami získanými standardně byla nalezena perfektní korelace pouze u 1 pacienta. U zbylých 14 pacientů... Philadelphia (Ph) chromosome, as a result of reciprocal translocation, is in majority of cases connected to two types of leukaemia - chronic myelogenous (CML) and acute lymphoblastic (ALL). The translocation occurs within large intronic sequences of BCR and ABL genes. The breakpoints are specific for individual patient and may be used as a target for monitoring of leukemic burden (MRD, minimal residual disease) during the treatment. In general, MRD is an important prognostic factor, which influences the treatment intensity. Two standardized methods are currently used for its monitoring. The first one is based on the detection of clonal specific Immunoglobulin and/or T-cell receptor genes rearrangements (and thus cannot be used for CML cases) at the DNA level, the second one utilizes detection of the BCR/ABL fusion gene at the mRNA level. Our aim was to optimize and standardize the process to find individual patient breakpoints on Ph chromosome and to use it for MRD quantification. We found the breakpoint in 80 % cases. The MRD data from 15 patients obtained by our method were compared to the levels obtained by standard methods (Ig/TCR and BCR/ABL transcript quantification). In all but 1 patient we found significant discrepancies, raising the questions about leukemic origin and the most accurate method for...
Keywords: ABL; Acute lymphoblastic leukaemia; BCR; Chronic myelogenous leukaemia; Ig; Minimal residual disease; quantitative real time PCR; TCR genes rearrangement; ABL; akutní lymfoblastická leukémie; BCR; Chronická myeloidní leukémie; Ig; kvantitativní PCR v reálném čase; minimální reziduální nemoc; TCR přestavby

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/54355

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-323649


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses