Original title: Molekulární metody v taxonomii a epidemiologii dermatofyt
Translated title: Molecular methods used for taxonomy and epidemiology of dermatophytes
Authors: Čmoková, Adéla ; Hubka, Vít (advisor) ; Hamal, Petr (referee)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2013
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
V bakalářské práci jsem se zabývala úlohou a aplikací molekulárních metod v taxonomii a epidemiologii dermatofyt a otázkou jejich druhového konceptu. V první části jsem se věnovala zhodnocení výhod a nevýhod současných druhových konceptů a jejich problematickou aplikací u skupiny dermatofyt. V druhé části jsem se zaměřila na molekulární metody používající genetické markery ke studiu fylogenetických vztahů a diskriminaci dermatofyt, např. metodu PCR-RFLP, PCR-fingerprintové metody a sekvenaci, kde jsem se věnovala především cílovým genům a jejich rozlišovací schopnosti. V poslední části práce jsem zmapovala molekulární metody užívané k typizaci izolátů na nižší než druhové úrovni, mezi které patří např. analýza mikrosatelitů, PCR-fingerprintové metody, multilokusová sekvenční typizace a jejich konkrétní případy využití v epidemiologii. In my bachelor thesis I have dealt with the role and aplication of the molecular methods in the taxonomy and epidemiology of the dermatophytes and the question of the species concepts in dermatophytes. In the first part, I focused on the evaluation of the advantages and disadvantages of the recent species concepts and their problematic application in dermatophytes. The second part is focused on the molecular methods that used genetic markers for phylogenetic analysis and species delineation within dermatophytes, e.g. the PCR-RFLP method, PCR-fingerprinting and DNA sequencing. I have evaluated the dicrimination power of the particular DNA sequence loci to distinguish closely related species. In the last part, I have summarized the molecular methods that have been used in the typization at the intraspecific level, e.g. microsatelite analysis, PCR-fingerprinting, multilocus sequence typing.
Keywords: dermatophytic fungi; microsatellite analysis; Microsporum; molecular sequencing; molecular typing; PCR-fingerprinting; phylogenetic analysis; polyphasic taxonomy; species concept; Trichophyton; analýza mikrosatelitů; dermatofytické houby; druhový koncept; fylogenetická analýza; Microsporum; molekulární typizace; PCR-fingerprinting; polyfázická taxonomie; sekvenování; Trichophyton

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/53047

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-322351


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses