Original title: Metodika detekce virů obilnin a trav pomocí SYBR Green I RT-qPCR
Translated title: Methods of detection of viruses from cereals and grasses using SYBR Green I RT-qPCR
Authors: Kumar, Jiban ; Jarošová, Jana ; Dráb, Tomáš ; Beoni, Eva
Document type: Methods
ISBN: 978-80-7427-204-2
Year: 2016
Language: cze
Publisher: Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i.
Abstract: [cze] [eng]
Čeleď Poaceae je zemědělsky nejdůležitější čeledí rostlin na světě. Čeleď Poaceae je také hostitelem mnoha patogenů včetně více než sta známých druhů virů. Rozložení výskytu jednotlivých druhů virů se liší v závislosti na hostitelích, zeměpisných a jiných podmínkách. Tato metodika poskytuje popis způsobu detekce devíti virů obilnin a trav: virus mozaiky sveřepu (BMV), virus žluté zakrslosti ječmene (BYDV), latentní virus jílku (LoLV), virus nekrotické mozaiky ovsa (ONMV), virus mozaiky jílku (RgMV), půdou přenosný virus mozaiky obilnin (SBCMV), virus skvrnitosti spartiny (SpMV), virus zakrsalosti pšenice (WDV), a virus čárkovité mozaiky pšenice (WSMV) pomocí metody SYBR Green I RT-qPCR. The family Poaceae is one of the most important groups of plants in the terms of agricultural production. The family Poaceae also hosts many pathogens including >100 known virus species. The distribution of the viruses varies according to hosts, geographical and other conditions. In this methodology we provide assays for detection of nine cereal and grass viruses (Brome mosaic virus-BMV, Barley yellow dwarf virus-BYDV, Lolium latent virus-LoLV, Oat necrotic mottle virus-ONMV, Ryegrass mosaic virus-Rg- MV, Soil-borne cereal mosaic virus-SBCMV, Spartina mottle virus-SpMV, Wheat dwarf virus-WDV a Wheat streak mosaic virus-WSMV) by SYBR Green I RT-qPCR.
Keywords: modulated signal detection; Poaceae; RT-qPCR; viruses; detekce; Poaceae; RT-qPCR; viry
Project no.: QJ1230159 (CEP), QH81269 (CEP)
Funding provider: Národní agentura pro zemědělský výzkum, Národní agentura pro zemědělský výzkum
Rights: This work is protected under the Copyright Act No. 121/2000 Coll.

Institution: Crop Research Institute (web)
External URL: http://www.vurv.cz/sites/File/Publications/ISBN978-80-7427-204-2.pdf

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-317265


The record appears in these collections:
Research > Scientific research institutions > Crop Research Institute
Analytical and methodological materials > Methods