Original title: Neutrální genetická variabilita a struktura populací kamzíka horského na Slovensku
Translated title: Neutral genetic variability and structure in chamois populations in Slovakia
Authors: Hájková, Andrea ; Zima, Jan (advisor) ; Kotlík, Petr (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2011
Language: slo
Abstract: [eng] [cze]
The Tatra chamois (Rupicapra rupicapra tatrica), an endemic mountain ungulate, occurs in the High Tatra Mts. (northern Slovakia and southern Poland). In the second part of the 20th century several chamois introductions occurred in Slovakia: Tatra chamois (from the High Tatra Mts.) were introduced into the Low Tatra Mts., while Alpine chamois (R. r. rupicapra) into the Veľká Fatra and Slovenský raj Mts. The High Tatra Mts. population underwent several population declines (bottlenecks) and all other Slovak populations were founded from only a few individuals (founder effect). Moreover, because the Low Tatra, Veľká Fatra and Slovenský raj are neighbouring mountain ranges, there is a potential risk of migration and hybridisation between the subspecies. Using 18 microsatellite loci, we studied neutral genetic variability, structure and potential hybridisation in chamois populations in Slovakia. The study is based on 193 samples: 95 tissue and 5 blood samples, and 88 faecal and 5 hair samples. Low genetic variability was found in all populations, the lowest one in High Tatra Mts. population. High values of fixation index, the number of private alleles, and factorial correspondence analysis indicated strong differentiation between the studied populations. Bayesian clustering divided Slovak chamois... Kamzík vrchovský tatranský (Rupicapra rupicapra tatrica) je endemickým poddruhom horského kopytníka vyskytujúceho sa na území Vysokých Tatier na Slovensku (a čiastočne v Poľsku). V druhej polovici 20. storočia sa na Slovensku uskutočnilo niekoľko introdukcií kamzíkov: kamzík vrchovský tatranský (z Vysokých Tatier) bol introdukovaný do Nízkych Tatier, zatiaľ čo kamzík vrchovský alpský (R. r. rupicapra) bol introdukovaný do Veľkej Fatry a Slovenského raja. Vysokotatranská populácia prekonala niekoľko výrazných poklesov početnosti (bottleneckov) a všetky ostatné slovenské populácie vznikli len z niekoľkých jedincov a teda boli vystavené efektu zakladateľa. Keďže Nízke Tatry, Veľká Fatra a Slovenský raj sú susediace pohoria, existuje možnosť migrácie a potenciálnej hybridizácie medzi poddruhmi. Cieľom tejto práce bolo štúdium neutrálnej genetickej variability a genetickej štruktúry populácií kamzíkov na Slovensku, so zameraním na detekciu prípadnej hybridizácie. Pre analýzy sme použili 18 mikrosatelitových lokusov a 193 vzoriek (95 tkanív a 5 vzoriek krvi, 88 vzoriek trusu a 5 vzoriek srsti). Vo všetkých populáciách bola zistená nízka genetická variabilita, pričom najnižšie hodnoty boli zaznamenané vo Vysokých Tatrách. Vysoké hodnoty fixačného indexu, počet privátnych alel, ako aj faktoriálna...
Keywords: bottleneck; effective population size; genetic variability; hybridisation; microsatellites; population genetic structure; Rupicapra rupicapra rupicapra; Rupicapra rupicapra tatrica; Slovakia; bottleneck; efektivní velikost populace; genetická variabilita; hybridizace; mikrosatelity; populačno-genetická struktura; Rupicapra rupicapra rupicapra; Rupicapra rupicapra tatrica; Slovensko

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/48206

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-312492


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses