Original title: Proteomická charakterizace membránových mikrodomén lidských NK buněk
Translated title: Proteomic characterization of human NK cell membrane microdomains
Authors: Kádek, Alan ; Man, Petr (advisor) ; Martínková, Markéta (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2012
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Proteomická charakterizace membránových mikrodomén lidských NK buněk. Bc. Alan Kádek (Katedra biochemie, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze, Česká republika) Přirozené zabíječské (NK) buňky jsou důležitou součástí neadaptivního imunitního systému. Uplatňují se zejména v boji proti nádorovým, virově infikovaným či jinak malformovaným buňkám. Plasmatická membrána NK buněk obsahuje oblasti se specifickým lipidovým složením v porovnání s okolní membránou (tzv. membránové mikrodomény či rafty). Mikrodomény jsou díky odlišné lipidové stavbě místem preferenčního výskytu některých imunologicky zajímavých proteinů a hrají roli v procesech buněčné polarizace a signalizace. Charakteristickou vlastností membránových mikrodomén je částečná rezistence vůči solubilizaci mírnými neionogenními detergenty. V této práci byly v rámci detergentu-rezistentní membránové frakce (DRM) izolovány mikrodomény z lidské buněčné linie NK-92MI a z NK buněk získaných imunomagnetickou separací z periferní krve neleukemických dárců. K izolaci byly využity detergenty Triton X-100 nebo Brij-98 a ultracentrifugace v sacharosovém gradientu. Proteinové složení izolovaných DRM bylo analyzováno hmotnostní spektrometrií metodou LC-MALDI- TOF/TOF. Seznamy identifikovaných proteinů z těchto analýz vykazují některé zajímavé... Proteomic characterization of human NK cell membrane microdomains. (in Czech) Bc. Alan Kádek (Department of Biochemistry, Faculty of Science, Charles University in Prague, Czech Republic) Natural killer (NK) cells are one of the important components of innate immune system. Their main function is to fight against tumors, virally infected or otherwise malformed cells. Plasma membranes of NK cells contain regions with specific lipid composition compared to the surrounding membrane (called membrane microdomains or rafts). Because of their lipid composition, microdomains preferentially accommodate some immunologically relevant proteins and play a role during cellular polarization and signalization. Characteristic feature of membrane microdomains is their partial resistance to solubilization by mild non-ionogenic detergents. In this thesis, microdomains were isolated in a detergent-resistant membrane fraction (DRM) from human NK-92MI cell line and from NK cells immunomagnetically enriched from peripheral blood of non-leukemic donors. For the isolation, Triton X-100 or Brij-98 detergent solubilization and ultracentrifugation in a sucrose density gradient was used. Protein composition of isolated DRMs was analyzed by mass spectrometry employing an LC-MALDI-TOF/TOF method. Protein lists generated in these...
Keywords: mass spectrometry (MS); membrane rafts; NK cells; hmotnostní spektrometrie (MS); membránové rafty; NK buňky

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/42796

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-307095


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses