Original title:
Molekulárně-dynamické simulace biomolekul
Translated title:
Molecular dynamics simulations of biomolecules
Authors:
Naništa, Ján ; Barvík, Ivan (advisor) ; Bok, Jiří (referee) Document type: Bachelor's theses
Year:
2012
Language:
cze Abstract:
[cze][eng] Práce se zabývá klasickými molekulárně-dynamickými simulacemi časového vývoje biomolekulárního systému. Modelovým systémem je membránový GPCR receptor pro dopamin typu D3 obklopený buněčnou membránou a vodní obálkou s ionty. Cílem bylo postihnout vazebnou schopnost Eticlopridu do aktivního místa GPCR receptoru.This study deals with classical molecular dynamics simulations of time evolution of a biomolecular system. The simulated system consists of the D3 GPCR membrane receptor for dopamine surrounded by a cell membrane and covered with water molecules and ions. The aim was to analyze the ability of Eticlopride to bind into the active site of the GPCR receptor.
Keywords:
Dopamine; Eticlopride; GPCR; Molecular dynamics; Dopamine; Eticlopride; GPCR; Molekulární dynamika
Institution: Charles University Faculties (theses)
(web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository. Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/42037