Original title: Molekulárně genetická analýza příčin vybraných dědičných forem kolorektální polypózy
Translated title: Molecular genetic analysis of the causes of selected hereditary forms of colorectal polyposis
Authors: Florianová, Martina ; Kohoutová, Milada (advisor) ; Křepelová, Anna (referee) ; Vodičková, Ludmila (referee)
Document type: Doctoral theses
Year: 2012
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Kolorektální karcinom (CRC) patří celosvětově k nejčastěji diagnostikovaným nádorům. Hereditární formy kolorektální adenomatózní polypózy jsou predispozicí pro vznik CRC. Mezi nejvíce studované syndromy patří familiární adenomatózní polypóza (FAP) podmíněná zárodečnými mutacemi v genu APC a MUTYH - asociovaná polypóza (MAP) podmíněná zárodečnými mutacemi v genu MUTYH. Cílem práce bylo objasnit genetické příčiny kolorektální polypózy v souboru probandů bez detekované zárodečné mutace v genu APC. V rámci práce byla testována přítomnost dlouhých delecí genu APC, byly hledány zárodečné mutace v genu MUTYH, případně zárodečné mutace v genu MSH6 u probandů s monoalelickou MUTYH mutací a dále byl testován vliv detekovaných APC variant na expresi genu. Vyšetření dlouhých delecí v genu APC bylo provedeno metodou MLPA v souboru 310 probandů bez detekované zárodečné mutace v genu APC. Mutační analýza celého genu MUTYH byla provedena v souboru 120 APC-negativních probandů metodou dHPLC. Dále byl vyšetřen exon 7 a exon 13 genu MUTYH u 145 APC-negativních probandů metodou HRM. Vliv detekované záměny na expresi genu APC byl testován u deseti variant. Metodou MLPA byli ve vyšetřovaném souboru detekováni 4 probandi s dlouhou delecí genu APC (frekvence 1,3%), což je nižší záchyt než v zahraničí. Funkční analýza... Colorectal cancer (CRC) is one of the most common cancers worldwide. Hereditary colorectal adenomatous polyposis syndromes are a predisposition to colorectal carcinoma development. The most common analyzed syndromes are familial adenomatous polyposis (FAP) that results from germline mutations in the APC gene and MUTYH - associated polyposis (MAP) caused by germline mutations in the MUTYH gene. The aim of this study was to clarify genetics causes of colorectal polyposis in a set of probands without the germline mutation in the APC gene. Within studyʼs scope the presence of large deletion in APC gene was tested, there was looked for germline mutations in MUTYH gene, alternatively germline mutations in MSH6 gene by probands with monoallelic MUTYH mutation, item there was tested an effect of detected APC variants on gene expression. Screening for large deletions was performed by multiplex ligation dependent probe amplification (MLPA). A set of 120 APC-negative probands was examined for the presence of germline MUTYH mutations by denaturing high performance liquid chromatography (dHPLC). Subsequently a set of 145 APC-negative probands was screened only for germline MUTYH mutation in exon 7 and 13 by high resolution melting (HRM) analysis. Analysis of the effect on expression was tested by ten APC...

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/41691

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-305991


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Doctoral theses