Original title: Charakterizace biologických a funkčních vlastností nového typu lidských CD27- paměťových B lymfocytů
Translated title: Characterization of biological and functional features of a new type of CD27- memory B lymphocytes.
Authors: Bajzíková, Martina ; Růžičková, Šárka (advisor) ; Šinkora, Marek (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2011
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
The increased frequencies of two novel B cell populations defined as IgM+ CD19+ CD27- CD21low CD38low CD24+ and IgM+ CD19+ CD27- CD21low CD38low CD24- in peripheral blood of patients with common variable immunodeficiency (CVID) compared to healthy donors were found. The aim was to search for such B cells in patients with rheumatoid arthritis (RA) and their further characterization. The production of immunoglobulin (Ig) mRNA in single B cells was analyzed using flow cytometry, single cell sorting and RT-PCR, IgVH-specific PCR, cycle sequencing and statistical analysis. The study was focused on analysis of variable regions of the heavy chains of Igs and significant differences in the usage of VH, DH and JH gene segments, mutational frequencies, distribution of silent and replacement mutations, length and composition of CDR3 regions, clonal relation and RAG gene expression in above mentioned B cell populations were found. Because of lack of the surface CD27 molecule being regarded as marker of B cells that have undergone antigen-driven germinal reactions, analyzed populations were considered as naive. However, the pattern and type of mutations suggested that these cells could represent a new type of differentiated memory/antigen- experienced B lymphocytes (in CVID less maturated) with the likely role in... V periferní krvi pacientů s běžným variabilním imunodeficitem (CVID) v porovnání se zdravými dárci byly pozorovány zvýšené frekvence dvou nových B buněčných populací definovaných jako IgM+ CD19+ CD27- CD21low CD38low CD24+ a IgM+ CD19+ CD27- CD21low CD38low CD24- . Cílem studie bylo nalezení takových B buněk u pacientů s revmatoidní artritidou (RA), jejich následná charakterizace a vzájemné porovnání. Produkce imunoglobulinové mRNA u jednotlivých B lymfocytů byla analyzována pomocí průtokové cytometrie s následným tříděním jednotlivých buněk, RT-PCR na úrovni jedné buňky, IgVH-specifické PCR amplifikace, cyklického sekvenování a statistické analýzy. Zaměřili jsme se na analýzu variabilních oblastí těžkého řetězce imunoglobulinů a zjistili jsme významné rozdíly v zastoupení VH, DH a JH genových segmentů, mutační frekvenci, distribuci tichých a záměnných mutací, délce a složení CDR3 oblastí, klonální příbuznosti a expresi RAG genů mezi výše zmíněnými B buněčnými populacemi. Analyzované populace byly považovány za naivní a to zejména z důvodu absence povrchové CD27 molekuly považované za marker B lymfocytů, které prošly antigenně řízenou germinální reakcí. Nicméně rozložení a typ mutací naznačují, že tyto buňky představují nový typ paměťových/antigenně zkušených B lymfocytů (u CVID méně diferencovaných)...
Keywords: B lymphocytes; CD antigens; common variable immunodeficiency; flow cytometry; rheumatoid arthritis; single-cell; VDJ rearrangement; B lymfocyty; běžný variabilní imunodeficit; CD antigeny; průtoková cytometrie; revmatoidní artritida; single-cell RT-PCR; VDJ přestavba

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/32753

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-297225


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses