Original title: Sinice spojené se stromatolitovými biofilmy v německém potoce Westerhöfer
Translated title: Cyanobacteria associated with biofilms of tufa stromatolites in the German creek Westerhöfer
Authors: Hodačová, Alena ; Eliáš, Marek (advisor) ; Řeháková, Klára (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2011
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Tato diplomová práce se zabývá sinicemi, které se nacházejí v biofilmu tufa stromatolitu pokrývající dno potoku Westerhöfer v Dolním Sasku v Německu. O sinicích tohoto potoku již byla práce napsána (ARP ET AL., 2010), ale pouze pro jedno odběrové místo (WB 5), a výsledkem této práce bylo šest nevysvětlených fylotypů sinic z devíti získaných. Moje diplomová práce má za úkol alespoň z části vyjasnit identitu těchto fylotypů a poukázat na další skupiny, které se zde vyskytují. Výsledky studie jsou rozděleny na dvě části. Na část zaměřenou na morfologii izolátů, které jsem extrahovala ze směsných vzorků všech odběrových míst v tomto potoce, a na fylogenetickou část, která zahrnuje analýzu sekvencí 16S rDNA mých izolátů a sekvencí získaných klonováním environmentální 16S rDNA, a to jak mých z vzorků po 2,5 měsících kultivace, tak také Kathrin I. Mohr (klonování ihned po odběru), která pracovala v laboratoři EPSAG přede mnou na stejném projektu. V morfologické části práce jsem identifikovala 11 morfotypů, odpovídajících tradičním rodům Aphanothece, Synechococcus, Cyanothece/Gloeothece, Leptolyngbya, Pseudanabaena, Limnothrix, Plectonema, Phormidium, Tolypothrix a Nostoc, dva izoláty nebylo možno jednoznačně přiřadit k žádnému morfotypu, jedná se o AH 5 a AH 35. Ve fylogenetické části jsem potvrdila polyfyletický... This diploma thesis is focused on cyanobacteria which occur in the biofilm of the tufa stromatolite covering the ground of Westerhöfer creek in Lower Saxony in Germany. A study of this creek has already been written (ARP ET AL., 2010) but only for one sampling site (WB 5), with six unidentified phylotypes of nine obtained as the result of that study. One of the aims of my diploma thesis is to identify at least some of them, and to show other groups occurring there. The results of my diploma thesis are divided into two parts. Part One - the morphology of isolates obtained from raw cultures of all sampling sites in the creek. Part Two - a phylogenetical study of 16S rDNA of the isolates and the sequences obtained by cloning of environmental 16S rDNA. The clones were obtained from Kathrin I. Mohr (who worked on the same project in the EPSAG laboratory and who did the cloning immediately after sampling). I also did cloning, but after 2.5 months of cultivation. In the morphological part, I identified 11 morphotypes, corresponding to established genera Aphanothece, Synechococcus, Cyanothece/Gloeothece, Leptolyngbya, Pseudanabaena, Limnothrix, Plectonema, Phormidium, Tolypothrix, and Nostoc. Two of isolates could not be assigned to any morphotype. It is isolate AH 5 and isolate AH 35. In the phylogenetical part I...

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/32685

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-297157


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses